Seq-Gen. simula l'evoluzione delle sequenze di nucleotide o amminoacidi
Scarica ora

Seq-Gen. Classifica e riepilogo

Seq-Gen. Tag

simulatore sequenza acido Titolazione acida. Proporzione nucleotidica carattere acido chiave Transazione acida Analisi di acido nucleico Sequenza nucleotidica Nucleotide Sequence Manager. nucleotide simulare l'evoluzione Trova aminoacido Finder Aminoacid cercare amminoacido Analizzatore di aminoacidi Sequenza di amminoacidi amminoacido Traduttore di amminoacidi Tema acido estrarre aminoacidi soluzione di acido residui di amminoacidi aminoacido ottimale Modello di sostituzione del nucleotide Motivo nucleotidrico Sequenza di acido nucleico Sostituzione del nucleotide Annotazione nucleotide Allineamenti nucleotidi Analizzare l'aminoacido acido nucleico analizzare la coppia di aminoacidi Analisi delle coppie degli aminoacidi Analisi della sequenza di aminoacidi Analizzare la sequenza di amminoacidi Classificazione di amminoacidi Topologia aminoacidica. simulatore di valutazione Rilevatore di amminoacidi rilevare aminoacidi polimorfismi nucleotidi. mutazione del nucleotide frazione nucleotidica Analizzare la catena di amminoacidi loop acido Transazioni acide Password hotmail Cracker. acid pro ACID Pro 7 applicazione giochi Macchina inglese Albania Bolle on line c3125 stampante inkjet sms inviato obiettivo pro per seq acqua Glock 26 Gen. Transformar ISO EM. Carta di credito Gen. Esami di pratica del sole UMD Gen.

Seq-Gen. Descrizione

SEQ-GEN è stato sviluppato per essere un programma che simularà l'evoluzione delle sequenze nucleotide o amminoacidi lungo una filogenicità, utilizzando modelli comuni del processo di sostituzione. Una gamma di modelli di evoluzione molecolare sono implementati compreso il modello reversibile generale. Possono essere fornite anche frequenze statali e altri parametri del modello e l'eterogeneità del tasso specifico del sito può anche essere incorporato in un certo numero di modi. Qualsiasi numero di alberi può essere letto e il programma produrrà qualsiasi numero di set di dati per ciascun albero. Pertanto è possibile creare facilmente grandi gruppi di simulazioni replicabili. È stato progettato per essere un simulatore di scopo generale che incorpora la maggior parte dei modelli comunemente usati (e computazionalmente trattabili) di evoluzione della sequenza molecolare. SEQ-GEN è un programma controllato dalla riga di comando scritta in ANSI C. Dovrebbe essere facilmente compilato ed eseguito su qualsiasi sistema UNIX o workstation. Questo documento descrive l'uso di Seq-Gen su una macchina UNIX. L'applicazione richiede una quantità di memoria proporzionale alla dimensione di ciascun set di dati di sequenza simulato. Esecuzione di Seq-Gen Per eseguire Seq-Gen Yoti: Seq-Gen <> Dove sono i parametri per il programma (descritto di seguito), è il file di albero e è il nome del file che conterrà le sequenze simulate. Il file dell'albero deve contenere uno o più alberi in formato Phylip. Le sequenze prodotte da SEQ-GEN sono scritte nell'output standard (e quindi possono reindirizzare al file di output utilizzando> ). Altre informazioni e risultati sono scritti nell'errore standard e quindi appariranno sullo schermo.

Seq-Gen. Software correlato