Mmodeltest.

programma C per selezionare i modelli di sostituzione del DNA usando PAUP
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Mmodeltest. Classifica e riepilogo

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  • Rating:
  • Licenza:
  • GPL
  • Nome editore:
  • Johan Nylander
  • Sistemi operativi:
  • Windows All
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Mmodeltest. Tag


Mmodeltest. Descrizione

Confrontando diversi modelli di DNA Evolution è un compito riservato per un particolare set di utenti, che hanno le conoscenze necessarie per estrarre informazioni utili. Hanno anche bisogno di strumenti specifici per condurre l'operazione e l'mrmodeltest è un'utilità specificamente progettata per il lavoro. Lavoro nel prompt di comando L'applicazione Screenthe non deve essere installata ed è basata sulla console. Ciò potrebbe distare un po 'dell'utente da esso, sebbene una volta avviato, presenta le istruzioni corrette sull'utilizzo di esso e dei comandi e degli argomenti supportati. Lo sviluppatore informa che lo strumento impiega test del rapporto di probabilità e AIC (criterio di informazioni AKAIKE), che misura una qualità relativa di un modello statistico per dati specifici. Ulteriori dettagli forniti dallo sviluppatore si riferiscono alla quantità di modelli di sostituzione del nucleotidica supportati dall'applicazione, che è impostato su 24, e tutti possono essere specificati nello strumento MRBAYES (utilizzato per la stima bayesiana della filogenicità). Elenco dei comandamenti supportatiSepitare un'interfaccia utente grafica, lavorare con MrModeltest potrebbe non essere troppo difficile per gli utenti che mira a destinazione, poiché la finestra della console mostra l'elenco dei comandi supportati. Il programma consente la selezione della gerarchia HLRT2 / 3/4 e definendo i livelli Alpha e Debug. Gli esempi sono presentati sullo schermo per facilitare le cose. C'è anche la possibilità di abilitare la modalità di calcolatrice AIC o LRT e impostare il numero di taxa. Per la maggior parte delle operazioni ci sono ulteriori strumenti che possono aiutare l'utente. Confronta il DNA Evolution ModelsMRmodeltest è una forcella dell'applicazione ModelTest che supporta quasi il doppio del numero di modelli di sostituzione del nucleotidica. Ma il suo vantaggio è che questi possono essere implementati nell'utilità di MRBAYES per la stima del filogenico. Recensito da Ionut Ilascu, ultimo aggiornamento il 2 giugno 2014


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