Gene ontologia. Uno sforzo per affrontare la necessità di descrizioni coerenti dei prodotti geni in diversi database.
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Gene ontologia. Descrizione

Uno sforzo per affrontare la necessità di descrizioni coerenti dei prodotti geni in diversi database. Il progetto GENE ONTOLOGY (GO) è uno sforzo collaborativo per affrontare la necessità di descrizioni coerenti dei prodotti geni in diversi database. I collaboratori GO stanno sviluppando tre vocabolari strutturati e controllati (ontologie) che descrivono i prodotti genici in termini dei loro processi biologici associati, componenti cellulari e funzioni molecolari in modo indipendente dalla specie. Ci sono tre aspetti separati a questo sforzo: prima, scriviamo e mantiamo le ontologie stesse; In secondo luogo, facciamo collegamenti incrociati tra le ontologie e i geni e i prodotti genici nei database di collaborazione; E in terzo luogo, sviluppiamo strumenti che facilitano la creazione, la manutenzione e l'uso delle ontologie. L'uso dei termini Go di diversi database di collaborazione facilita le query uniformi tra loro. I vocabolari controllati sono strutturati in modo da poter interrogare a livelli diversi: ad esempio, Puoi usare Vai a trovare tutti i prodotti genici nel genoma del mouse che sono coinvolti nella trasduzione del segnale, oppure è possibile ingrandire tutti i recettori della tirosina Kinases. Questa struttura consente inoltre agli annitatori di assegnare proprietà ai prodotti Gene a diversi livelli, a seconda di quanto è noto su un prodotto genico.

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