Seqan. Libreria di analisi della sequenza libera e C ++
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Seqan. Classifica e riepilogo

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Seqan. Descrizione

Libreria di analisi della sequenza gratuita e C ++ Seqan è una libreria C ++ gratuita e open source di algoritmi e strutture di dati efficienti per l'analisi delle sequenze con la messa a fuoco dei dati biologici. Seqan applica un design generico unico che garantisce prestazioni elevate, estensibilità, generalità e integrazione con altre librerie.seqan è facile da usare e semplifica lo sviluppo di nuovi strumenti software con una minima perdita di prestazioni. Cosa c'è di nuovo in questa versione: · Altre 5 applicazioni, I.e. DFI, microrazers, Paiaalign, SeqCons, Trerecon · Rilascio stabile dei rasers che supportano la mappatura della lettura anteriore e la sensibilità configurabile · Nuovi algoritmi di allineamento, ad es. Allineamenti band, configurabili (sovrapposti, semi-globali, ...) · Algoritmo di riallineamento · Strutture e formati di dati NGS, ad es. Sam, Amos, ... · Nuovi alfabeti, ad es. DNA con qualità di chiamata base, caratteri del profilo · Strutture dati ausiliarie e algoritmi, ad es. Queue doppia coda, parser della riga di comando · Punteggi posizionali · Supporto cmake.

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