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TFM-Explorer. Classifica e riepilogo
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- Licenza:
- Freeware
- Nome editore:
- Bonsai Bioinformatics group
- Sistemi operativi:
- Windows All
- Dimensione del file:
- 11.3 MB
TFM-Explorer. Tag
TFM-Explorer. Descrizione
TFM-Explorer è un programma per analizzare le regioni normative dei genomi eucariotici. Ci vuole una serie di sequenze genetiche coregolate e cerca i siti di biding del fattore di trascrizione localmente sovrarapresente. L'algoritmo procede in due passaggi: · Scansioni Sequenze per rilevare tutti i potenziali siti di rilegatura del fattore di trascrizione, utilizzando le matrici di peso da Jaspar o Transfac · Estrae cluster significativi (regione delle sequenze di input associati a un fattore) calcolata una funzione di punteggio TFM-Explorer consente inoltre di visualizzare i cluster dei risultati e i loro siti di biding del fattore di trascrizione putativo sulle sequenze di input e per cercare moduli normativi CIS. Ottieni TFM-Explorer e fai andare a vedere cosa può effettivamente fare per te!
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