Semphy. Uno strumento per la ricostruzione filogenetica intensiva dei dati
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Semphy. Classifica e riepilogo

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Semphy. Descrizione

Semphy è stato sviluppato per essere uno strumento per la ricostruzione filogenetica intensiva da dati. Semphy definisce filogeni per la massima probabilità, il criterio più stabilito per trovare l'albero filogenetico corretto. Semphy cerca sia la topologia più probabile dell'albero evolutivo, sia le lunghezze ottimali dei suoi rami. Utilizza il paradigma algoritmico di EM strutturale in un nuovo metodo computazionale per l'inferenza filogenetica, rendendo il calcolo sia efficace che efficiente: Semphy può gestire set di dati molto grandi con una buona precisione e un tempo di esecuzione ragionevole. Faremo riferimento alla procedura EM come "Semphy Step". Tutti gli usi di SEMPHY sono chiamando il SEMPHY eseguibile da un prompt dei comandi con alcuni parametri: Semphy

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