Investigatore di proteine

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Investigatore di proteine Classifica e riepilogo

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Investigatore di proteine Descrizione

Molti esercizi di laboratorio utilizzano software di visualizzazione molecolare che consente agli studenti di "vedere" una proteina nella sua piena forma tridimensionale e di fare ipotesi sulle interazioni tra varie catene laterali. Tuttavia, questi programmi non consentono agli studenti di testare le loro ipotesi perché il software di visualizzazione molecolare non consente agli studenti di apportare modifiche alla sequenza proteica e osservare i loro effetti sulla struttura e sulla funzione della proteina. Protein Investigator è uno strumento molto utile progettato per offrire agli utenti l'opportunità di esplorare in modo interattivo la struttura e la funzione di proteine in un sistema semplificato. Questo è un modello altamente semplificato di piegatura proteica. Non è destinato a prevedere le strutture corrette di qualsiasi proteina; È progettato per illustrare i principali principi coinvolti in tale processo. Caratteristiche principali: Gli aminoacidi dispongono di catene laterali di variare idrofobicità, carica e capacità di incollaggio dell'idrogeno. Gli aminoacidi sono ricollegati in una catena non ramificata che può piegarsi. Gli aminoacidi idrofobici tendono ad evitare l'acqua che circonda la proteina; Gli aminoacidi idrofili si legano all'acqua. Gli amminoacidi che possono formare legami di idrogeno tendono a formare legami di idrogeno se possono. Gli amminoacidi caricati in modo positivo tendono a formare legami ionici con aminoacidi caricati negativamente se possibile. Like-Aminoacidi caricati si restringeranno se possono. Interazioni Ioniche sono più forti delle obbligazioni di idrogeno, che sono più forti delle interazioni idrofobiche. Le proteine possono essere piegate in ossidazione (legami disolfuro attiva) o ridurre le condizioni (disulfuoli obbligazioni disattivate).


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