Fastml. Un programma per calcolare le sequenze di aminoacidi ancestrali di un albero filogenetico
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Fastml. Classifica e riepilogo

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Fastml. Descrizione

Fastml è stato sviluppato per essere un programma per calcolare le sequenze di aminoacidi ancestrali di un albero filogenetico. Utilizzo: Fastml utilizza i flags nella riga di comando Argomenti: -Per aiuto, digitare "fastml.exe -h" -s seq.aln = il nome del file di input della sequenza. -t tree.txt = il nome del file dell'albero di input (formato di newick). Il programma riconosce automaticamente uno qualsiasi di questi formati di sequenza: Phylip, Molphy, Fax, Mase, Clusal o Nexus. Utilizzare l'opzione -m per scegliere un modello. Sono supportati i seguenti modelli (per amminoacidi): Giorno, JTT, Rev, Cprev, WAG, JC. Per i nucleotidi, attualmente è supportato solo il modello JC. Il modello predefinito è il JTT.

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