Erminej. Analizza i set geni con questa applicazione.
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Erminej. Classifica e riepilogo

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analizzatore analisi espressione espressione genica gene analizzare applicazione imposta Analizza il set di gene Trova il set di geni sotto il sottoinsieme del gene Ricercatore del sottoinsieme del gene. Sottosieme di Gene Gen Visualizza dati genici Visualizza i dati geni Analizza l'espressione del gene Correlazione genica correlare il gene. Analizza il gene. Organizzazione genica visualizzazione gene Confronta il gene. comparatore genico Modello genico gene candidato simulare la mutazione genetica Adiacenza gene Annotazione genica database di Gene Ontology Gene ontologia. Crea rete genica Generatore di rete Gene. Informazioni genetiche associazione di prodotti genici associazione di malattie genetiche Identificatori genici Traduttore. Previsione della funzione genica identificazione del gene Analizzare la struttura del gene Analizzatore della struttura genica Gene Mapper. Confronto dell'ordine del gene confrontare l'ordine dei geni Contenuto genico derivato Analizzare il gene di codifica proteica Selezione genica Analizza i set di dati genetici Analizzare 16s Sequenza genetica RRNA Grappolo genico ancestrale. calcolatore del cluster genetico Gene ancestrale Gene cluster. analizzare i dati genetici Analisi dei dati genica Espressione dati micro-array Analizza i marcatori geni trasferimento genico simulare la crescita della rete genica duplicazione genica Analizza i dati della frequenza del gene stimare le diversità geniche Test di diversità geniche Diversità genetica Sequenza genica Interazione genica-genica Sequenza genica Nome. Affidabilità dei cluster geni Analizzare il gene del modificatore mappare il gene della malattia Visualizza il gene. esplorare gene Visualizza Gene.

Erminej. Descrizione

ERMINEJ è uno strumento utile e facile da usare progettato per aiutarti a eseguire analisi dei set di geni nei dati di micro-array di espressioni o altri dati a livello del genoma che si traducono in classifiche dei geni. Un obiettivo tipico è determinare se particolari percorsi biologici stanno "facendo qualcosa di interessante" nei dati. Il software è progettato per essere utilizzato da biologi con poco o nessun background informativo. Caratteristiche principali: L'implementazione di più metodi per l'analisi del set di geni: Analisi eccessiva della rappresentazione Un metodo basato sulla ricampionamento che utilizza i punteggi geni Un metodo basato sulla classifica che utilizza i punteggi geni Un metodo basato sulla ricampionamento che utilizza la correlazione tra i profili di espressione genica (un tipo di analisi "arricchimento del cluster"). I set geni ricevono punteggi statistici (valori P) e viene supportata più correzione del test. supporto della terminologia del gene ontologia; Gli utenti possono scegliere quali aspetti da analizzare. I file utente utilizzano formati di testo semplici. Gli utenti possono modificare i set di geni o crearne di nuovi. I risultati possono essere visualizzati all'interno del software. È semplice confrontare più analisi degli stessi dati impostati con diverse impostazioni. i collegamenti ipertestuali definibili dall'utente sono forniti ai siti esterni per consentire una navigazione più efficiente dei risultati. Per i programmatori, c'è un'interfaccia della riga di comando nonché un'interfaccia di programmazione dell'applicazione semplice che può essere utilizzata per collegare la funzionalità Erminej nel proprio codice

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