DRAGONO DNA.

DNA Sequence Contig Assembler Software
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DRAGONO DNA. Classifica e riepilogo

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DRAGONO DNA. Descrizione

DNA Dragon è un programma di utilità avanzato di DNA in grado di gestire più di 100000 campioni di formati di sequenza (FASTA, EMBL, GenBank, ecc), i formati di file di traccia (SCF, ABI, AB1) e formati di file di sequenziamento di nuova generazione (Illumina, SFF, GFF , eccetera). Nota : Il processo può essere attivato tramite il pulsante "licenza" nel software. Caratteristiche principali: Legge i formati più popolari di sequenza:. (FASTA, GenBank, EMBL, SCF, ABI, AB1, SSF, Next Generation) multipla rifilatura caratteristiche:. Vettoriale, la qualità e la durata della guarnizione veloce assemblaggio macchina gestisce progetti con più di 100000 sequenze. formati di file supportati: I file di progetto: progetto XML XML DNA Dragon (* .xml) formati di file Sequenza: EMBL (* .eb;. * Ebi; *. EMBL) GenBank (* ..gb; * generazione;. * GenBank,.. * Txt) FASTA (* .FA; * fas;. * Veloce; *. Fasta;. * Fs;. * FSA;.. * FSTA) Avanti formati di file sequenziamento di nuova generazione: file solid ABI (* .gff) file CSFASTA solidi (* .csfasta) Solexa Compact ASCII leggere il formato, SCIARPA (s _ * _ sequence.txt) Illumina _seq.txt file (* .txt) file Illumina FASTQ (* .fastq) file Illumina Qseq (* _qseq.txt) 454 file Flowgram standard (* sff) formati di file di allineamento: Sequenza Allineamento / Mappa (SAM) Format (* .sam) Binary Allineamento Format (* .bam) (* .bam) formati di file di traccia: SCF (* .scf) ABI (* .abi;. * AB1) Navigator albero: albero Un campione navigatore rende la struttura del progetto (contig e campioni) molto chiaro. Da qui i campioni sono selezionati, poi tagliati e assemblati. Taglio e le caratteristiche untrimming: Primer-clipping Vector-clipping con pseudocircularization automatica (50 basi). È possibile rilevare motivi vettore putativi nelle sequenze senza alcuna conoscenza precedente. Sequenza di qualità a base di taglio Lunghezza taglio Untimming:. Estremità tagliate ripristini montaggio della macchina e redattore da affittare: Varie opzioni per cambiare i parametri di montaggio sono disponibili. Il digiuno, indice a base assemblaggio di sequenze con selezione automatica delle sequenze all'interno contig (offset e termina assetto) rende la gestione del progetto un piacere. La revisione di contig (allineamento di sequenza), cioè confronto delle basi con loro tracce, e l'esportazione / copiare delle sequenze consenso è quasi auto-esplicativo.


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