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DRAGONO DNA. Classifica e riepilogo
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DRAGONO DNA. Tag
- assemblatore sequenza Sequenza del DNA assemblatore panoramico Dna. Assembler Filelist. Assembler Language. Contig Menu. add contig Defrag di Contig. Contig. Assembleratore guidato da plugin Assembleo del plugin. Software di assembler. assemblatore barra degli strumenti programma assembler assemblatore di applicazione convertire la sequenza del DNA. Page Assembler. modifica contig Leggi la sequenza del DNA. Lettore di sequenze di DNA Analizzare la sequenza del DNA. Modifica la sequenza del DNA. DNA Sequence Editor. Visualizza la sequenza del DNA. Analisi della sequenza del DNA. Analizzatore di sequenza del DNA. Allineare la sequenza del DNA. Confronta la sequenza del DNA. Rimuovi il montaggio Impara Assembler. Assemblatore piatto di FASM. Codice Assembler. APNG assembler Jit Assembler. assemblatore C++ raccolta assembler Crea assembler DTO. Manipolazione della sequenza del DNA. dati di sequenza del DNA allineati Sequenza genomica del DNA. comprimere la sequenza del DNA Compressione della sequenza del DNA. codifica la sequenza del DNA. Compressore della sequenza del DNA. Dati di sequenza del DNA. Assembler di base Analizza i dati della sequenza del DNA Analisi dei dati della sequenza del DNA Analizzare la sequenza del DNA. Assembler DNA. Traccia DNA. Visualizzazione della sequenza del DNA. DNA Sequence Evolution. .NET Assembler. Spectra cross-contigg
DRAGONO DNA. Descrizione
DNA Dragon è un programma di utilità avanzato di DNA in grado di gestire più di 100000 campioni di formati di sequenza (FASTA, EMBL, GenBank, ecc), i formati di file di traccia (SCF, ABI, AB1) e formati di file di sequenziamento di nuova generazione (Illumina, SFF, GFF , eccetera). Nota : Il processo può essere attivato tramite il pulsante "licenza" nel software. Caratteristiche principali: Legge i formati più popolari di sequenza:. (FASTA, GenBank, EMBL, SCF, ABI, AB1, SSF, Next Generation) multipla rifilatura caratteristiche:. Vettoriale, la qualità e la durata della guarnizione veloce assemblaggio macchina gestisce progetti con più di 100000 sequenze. formati di file supportati: I file di progetto: progetto XML XML DNA Dragon (* .xml) formati di file Sequenza: EMBL (* .eb;. * Ebi; *. EMBL) GenBank (* ..gb; * generazione;. * GenBank,.. * Txt) FASTA (* .FA; * fas;. * Veloce; *. Fasta;. * Fs;. * FSA;.. * FSTA) Avanti formati di file sequenziamento di nuova generazione: file solid ABI (* .gff) file CSFASTA solidi (* .csfasta) Solexa Compact ASCII leggere il formato, SCIARPA (s _ * _ sequence.txt) Illumina _seq.txt file (* .txt) file Illumina FASTQ (* .fastq) file Illumina Qseq (* _qseq.txt) 454 file Flowgram standard (* sff) formati di file di allineamento: Sequenza Allineamento / Mappa (SAM) Format (* .sam) Binary Allineamento Format (* .bam) (* .bam) formati di file di traccia: SCF (* .scf) ABI (* .abi;. * AB1) Navigator albero: albero Un campione navigatore rende la struttura del progetto (contig e campioni) molto chiaro. Da qui i campioni sono selezionati, poi tagliati e assemblati. Taglio e le caratteristiche untrimming: Primer-clipping Vector-clipping con pseudocircularization automatica (50 basi). È possibile rilevare motivi vettore putativi nelle sequenze senza alcuna conoscenza precedente. Sequenza di qualità a base di taglio Lunghezza taglio Untimming:. Estremità tagliate ripristini montaggio della macchina e redattore da affittare: Varie opzioni per cambiare i parametri di montaggio sono disponibili. Il digiuno, indice a base assemblaggio di sequenze con selezione automatica delle sequenze all'interno contig (offset e termina assetto) rende la gestione del progetto un piacere. La revisione di contig (allineamento di sequenza), cioè confronto delle basi con loro tracce, e l'esportazione / copiare delle sequenze consenso è quasi auto-esplicativo.
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