Chimica :: File :: PDB Reader / scrittore del formato del file della banca dati della proteina
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Chimica :: File :: PDB Descrizione

Lettore / scrittore del formato del file della banca dei dati della proteina Chimica :: File :: PDB è un modulo perl che legge e scrive file PDB. Il formato del file PDB è comunemente utilizzato per descrivere le proteine, in particolare quelle memorizzate nella banca dati proteica (http://www.rcsb.org/pdb/). La versione corrente di questo modulo legge solo i seguenti tipi di record, ignorando tutto il resto: Atom Hetatm Endmdl Endthis Module registra automaticamente il formato "PDB" con Chimica :: MOL, in modo che i file PDB possano essere identificati e letti da chimica :: > Leggi (). Per i pupitori di autodetection, presuppone che i file che terminano in .pdb o avendo una corrispondenza di linea / ^ (Atom | hetatm) / sono file PDB. I PDB Reader e Writer sono progettati per gestire gli oggetti Chimica :: Macromol, ma può anche creare E usa Chimica :: Mol Objects lanciando alcune informazioni Away.Synopsis use chimica :: File :: PDB; # Leggi un file pdb my $ macro_mol = chimica :: macromol-> leggi ("myfile.pdb"); # scrivi un file PDB $ macro_mol-> scrivi ("out.pdb"); # Leggi tutti i modelli in un file multi-modello My @mols = Chimica :: Macromol-> Leggi ("models.pdb"); # Leggi un modello alla volta il mio file $ $ = chimica :: macromol-> file ("models.pdb"); $ file-> Apri; while (My $ MOL = $ file-> read_mol ($ file-> fh)) {# Fai qualcosa con $ MOL} Requisiti: · Perl.

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