Vistoso

Analisi di percorso semplificata.
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Vistoso Classifica e riepilogo

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  • Rating:
  • Licenza:
  • Freeware
  • Nome editore:
  • VisANT Team
  • Sistemi operativi:
  • Windows All
  • Dimensione del file:
  • 375 KB

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Vistoso Descrizione

Visant è una semplice applicazione semplice, pratica, facile da usare, progettata appositamente per aiutarti con l'analisi della rete e del percorso. Il viso è scritto utilizzando il linguaggio di sviluppo Java. Caratteristiche principali: Analisi dell'arricchimento del modulo di rete (NMEA) per rilevare la differenza fenotipica tra due set di dati (ad esempio espressione genica della malattia V.S. Normale), provare NMEA per il percorso del ciclo cellulare nei dati mutanti P53. NMEA è degnato per trovare moduli funzionali che informano le differenze fenotipiche. Per la versione corrente, tali differenze sono di solito attività trascrizionale. NMEA per impostazione predefinita verrà eseguito per tutti i metanodes non incorporati. La funzione è disponibile sotto il menu di espressione e richiede l'ingresso dei dati di espressione (dati di espressione del campione). Quando l'esecuzione di NMEA è completa, i nodi nei moduli saranno colorati in base ai loro punteggi di arricchimento Go Term Analisi di arricchimento (GOTEA) per trovare i termini GO sovrapponzati nei moduli di rete. La funzione è disponibile sotto il menu di Medagraph e richiede i geni nei moduli che vengono annotati. La modalità batch automatizza le query del database per interazioni, risoluzioni dei nomi e annotazioni vanno, Modalità batch per automatizzare i processi batch in background e gestire reti su larga scala con milioni di nodi e bordi. Meta-grafico: visualizzazione multi-in scala di bio-reti, ideale per la rete di moduli funzionali, Caricamento in batch veloce dei dati di interazione di grandi dimensioni impostati tramite la pagina Statistiche interazione. Schema visivo flessibile della rete: Annotazione NODEEDGE personalizzata, Data-Mining integrativo: 405k + associazioni funzionali (sperimentali: 98924, computazionale: 307017) Per 103 specie, name normalizzazione per il lievito, volare, homo sapiens ecc., ad alte prestazioni regolabili, supporta la rete di grandi dimensioni, il test è stato eseguito con bordi 226k + e nodi Easy HTTP che collega alla rete e supporto incorporato di SVG ad alta risoluzione Espressione Sovrapposizione della rete / percorso Sistema di raccomandazione basato sui dati di espressione integrata per il gene nello stesso percorso / complesso / rete Navigazione esplorativa dei percorsi Kegg. Supporto della rete ponderata con lo spessore del bordo o il colore del bordo, o entrambi.


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