Utilità di previsione del tempo di eluizione normalizzata (rete) I valori del tempo di eluizione normalizzati previsti per le sequenze del peptidico
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prevedere calcolare Normalizzato VBR MP3 Viewer peptide. peptide Computa la differenza di tempo frammentazione peptidica Sequenza del peptide Informazioni sui peptidi Il frammento peptidico analizzatore prevedere la frammentazione del peptide analizzare il peptide. distribuzione del peptide. risultato del colpo del peptide Modello del peptide. Estrattore peptide. Identificazione del peptide. Peptide maldi. Statistiche del peptide peptide proteotipico Valutazione del peptide allineatore peptidico allineare il peptide. tempo di eluizione normalizzato Previsione netta Frammenti di peptidi di Genespring Aggiungi valori del tempo Analisi del peptide

Utilità di previsione del tempo di eluizione normalizzata (rete) Descrizione

L'utilità di previsione del tempo di eluizione normalizzata (net) è una piccola utilità progettata per calcolare i valori NET Normalizzati (net) previsti per un elenco di sequenze di peptidi. I tempi di eluizione sono destinati all'uso con analisi della cromatografia liquida di fase invertita (ad esempio utilizzando le analisi di particelle di silice rivestite C18) e vengono utilizzate nel nostro laboratorio per l'allineamento dei set di dati LC-MS e LC-MS / ms all'altro (utilizzando i tempi di eluizione previsti Per formare un set di dati master in-silico per allineare ogni set di dati a). I tempi di eluizione previsti vengono anche utilizzati dal simulatore di digestione proteico Basic BASE quando si calcola il numero di peptidi identificabili in modo univoco all'interno di un file di input utilizzando la massa e la rete. L'utilità di predizione netta legge i peptidi da un file di testo contenente una sequenza peptidica su ciascuna riga. Il file di output include la sequenza peptidica più il valore netto previsto (e / o il valore SCX previsto) utilizzando uno o tutti gli algoritmi di previsione: · Modello tempo di ritenzione di Kangas / Petritis LC · Modello di frazione di Kangas / Petritis SCX · Modello di idrofobicità Krokhin · Modello di idrofobicità della mantello

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