L'applicazione Tweenmotif è stata sviluppata per essere un programma interattivo di Windows per visualizzare le posizioni di un motivo target specificato all'interno di un insieme di sequenze, così come gli spazi tra i motivi di ripetizione. Il programma crea una tabella riassuntiva dei conteggi di frequenza delle sequenze di gap che possono essere incollate in un foglio di calcolo Excel per ulteriori analisi.
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