Peakfinder. Individua picchi (siti di rilegatura della coecenzione) nei dati di microarry chip di lievito
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Peakfinder. Classifica e riepilogo

Peakfinder. Tag

Cercatore localizzatore alter protocollo vincolante mostra protocollo vincolante Binding del protocollo picco Seleziona rilegatura attacco degli sci Implementare vincolanti Renderman Binding. Meccanismo di rilegatura flessibile associazione dati rilegatura C ++ a Lua Legatura creare un legame Genera vincolante rilegatura Qt 4 Binding. vincolanti .NET Set di rilegatura Screensaver Twin Peaks. cime gemelle OpenCL API Binding. binding Qt rilegatura in pitone Trova il picco trovare il picco Locator di picco. Visualizza le cime cromatografiche Analisi dei picchi cromatografici Binding API del database TRI PICKS. ja. testo creatore del mosaico Drop Aid 1.0. Taglierina della suoneria N73. Scarica Tor Browser USB rimuovere in modo sicuro Adobe Acrobat5 Serial. Nero Plugin Lame. scrittore php NRG File Extractor. negozio di carrozzeria sims3pack driver ethernet universale driver bluetooth ivt

Peakfinder. Descrizione

L'applicazione di PeakFinder è stata sviluppata per essere uno strumento che individua i picchi (siti di rilegatura della coesione) nel chip di lievito (immunoprecipitazione della cromatina) dati di microarry. Peakfinder è uno strumento di visualizzazione del genoma che cerca i dati del rapporto di microarray per "picchi". Le vette si trovano usando una curva levigata che può essere scelta in modo interattivo. Il contenuto di nucleotidi utilizzando una finestra mobile specificata può essere visualizzata insieme ai risultati del microarray. Il programma è quasi geniale per qualsiasi genoma, ma ha ancora alcuni parametri solo del lievito. File di input: - File Genomededex.dat: coordinate raccontano la posizione di ciascun cromosoma all'interno del genoma. Anche la posizione Centromere è specificata. - "Coordinate di funzionalità" Foglio di lavoro Excel: colonne A, B e C devono essere nominate, coord1, coord2. Le coordinate sono coordinate genome per ogni funzione. - Foglio di lavoro "rapporti" di Excel con dati microarray: colonna A deve essere "inamake". Si presume che i dati del rapporto siano presenti nell'ultima colonna. La funzione I valori "anamed" devono macare quelli specificati nel foglio di lavoro delle coordinate della funzione. - Directory con sequenze di nucleotidica, un file per ogni cromosoma. I dati di sequenza possono essere in formato FastA con un defline o semplicemente un file ASCII. I nomi dei file devono essere Chr * o Chrnn *. Ad esempio, ChR05.FSA o CHRIVIII_562639.ASCII. Il formato di file "vecchio" o "nuovo" del database del genoma del saccharomyces è accettabile. - PeakFinder.ini è nella directory c: \ Documents and Settings \ Impostazioni locali \ DATA DI APPLICAZIONE \ Stowersinstitute \ Peakfinder File di output: - Il grafico viene automaticamente posizionato negli Appunti, se è selezionata l'opzione bitmap o metafile e può essere immediatamente incollata in qualsiasi altra applicazione dopo che viene visualizzata. (Deselezione della casella Grafico Salva automatica arresta questo posizionamento automatico del grafico negli Appunti). In caso contrario, premere il pulsante Salva sul foglio scheggia per salvare il grafico in un file GIF specificato. - Il pulsante Salva Peaks sul foglio di picchi può essere selezionato per salvare un file di picco.csv, che può essere aperto in Excel. - Il pulsante "Processo tutto" sul foglio tabelle rawData deriva da un insieme di file prodotti. Normalmente specificare una nuova directory e conterrà questi file quando l'elaborazione è completa: ratiofilename.dat, ratiofilename-chromosomennn.gif (nn = da 01 a 16) e ratiofilename -aks.csv, dove ratiofilename è il nome del rapporto Excel File specificato nel foglio schede di dati RAW.

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