TESD. simula il numero di copie genomiche in diverse popolazioni di generazioni
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TESD. Classifica e riepilogo

TESD. Tag

simulare simulatore Metilazione della regione genomica Metilazione genomica Visualizza informazioni genomiche Analizza le informazioni genomiche Viewer Genomic Information. Visualizza dati genomici Visualizzatore di dati genomici Esplora i dati genomici sequenza genomica dei mammiferi simulatore di genomica simulazione genomica Simulatore di elementi genomico Generazioni di Wright-Fisher Accedi alla diversità genomica Simulazione dei dati genomici analizzare i dati genomici Variazione strutturale genomica Genomic loci. Annotator genomico

TESD. Descrizione

Il nome TESD stand per Dynamics del simulatore di elementi trasponibili. TESD è stato sviluppato per essere un'applicazione scientifica. TESD simula il numero di copie genomiche in diverse popolazioni di generazioni (secondo il modello dell'isola), utilizzando modelli classici di TE Dynamics. I parametri dei modelli (trasposizione e tassi di trasposizione e escissione, intensità della selezione, tasso di ricombinazione, tasso di migrazione, dimensioni della popolazione e numero di popolazioni) sono definiti dagli utenti. Per renderlo più user-friendly, TESD ha un'interfaccia grafica. Gli utenti possono impostare i vari valori dei parametri utilizzando moduli che fanno domande. I risultati delle simulazioni sono visualizzati grazie agli strumenti grafici incorporati, utilizzando la libreria JFreeChart. TESD fornisce un'applicazione completa che consente ai modellisti di attuare altri modelli di TE Dynamics. TESD è implementato in Java, un linguaggio orientato all'oggetto che può essere esteso facilmente, e questo significa che TESD può essere eseguito su tutti i sistemi operativi (Linux, Mac, Windows, Solaris, ecc.).

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