Simdiv. Genera set di dati sotto un isolamento con il modello di migrazione
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Simdiv. Classifica e riepilogo

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Simdiv. Descrizione

Simdiv è stato sviluppato per essere un programma che può essere utilizzato nel laboratorio di hey per generare set di dati in un isolamento con il modello di migrazione. Può essere utilizzato per più popolazioni per una varietà di modelli di mutazione - praticamente per qualsiasi tipo di set di dati per cui è possibile utilizzare i programmi IM e correlati. Simdiv non è l'unico programma che può farlo. Ci sono molti altri simulatori coalescenti là fuori, e uno che so può essere utilizzato per l'isolamento con i modelli di migrazione è simaal, ma potrebbero esserci altri. Simdiv simulerà i dati con ricombinazione se gli utenti specificano, anche se i programmi IM non assumono alcuna ricombinazione. Il programma può gestire fino a 10 popolazioni, con 350 copie genetiche per locus, per qualsiasi numero di loci. Se desiderato un utente può caricare tutte le specifiche associate a un set di dati reali (loci #, dimensioni del campione, modelli di mutazione e stime dei parametri IM) in modo che i risultati IM / SIMDIV possano essere confrontati con i dati reali utilizzati per generare il stime dei parametri. Per gli utenti IM Simdiv dovrebbero essere abbastanza facili da usare perché i parametri significano le stesse cose e sono ridimensionati nello stesso modo in Simdiv e i programmi IM.

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