STELO Stima dell'albero delle specie usando la massima verosimiglianza
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analisi Stima dei costi stima stima del tempo Stima del movimento massimo Stima del cff3 specie gene specie di uccelli la stima del software stima dei parametri stima disparità Specie cetacea. creare specie. generare specie. Stima della FDR stima di aplotipo Albero delle specie Monitor della specie. stima delle prestazioni Creatore di stima stima dell'osmosi probabilità gerarchica stima dell'albero filogenetico Stima dei parametri del modello Grande stima filogenante Grandi stima di Phylogenies. Lunghezza del ramo Gene Tree. stima dell'albero Allele massimo di probabilità stima condotto stima sforzo Stampa stima Massimo LinkDepth.

STELO Descrizione

Stelo è stato sviluppato per essere un programma per inferire le specie di massima verosimiglianza alberi da una raccolta di alberi di gene stimati sotto il modello coalescente. Il programma restituirà l'esatto albero ml, calcola la probabilità per un albero specificato dall'utente o cerca una serie di alberi più alti di parametro. Il metodo per la ricerca dello spazio degli alberi è un algoritmo di ricottura simulato. Lo stelo richiede diversi file di input. Il primo di questi è il file che fornisce le informazioni Per gli alberi genici, che devono essere chiamati genêtres.tre. Questo fi ra contiene gli alberi genici con le lunghezze dei rami nel formato di newick. Gli alberi genici devono essere radicati e devono soddisfare l'orologio molecolare, sebbene il programma non controllerà questo (probabilmente avrete un errore o verrà eseguito indatto se non è così). Direttamente davanti ad ogni albero genetico è un numero all'interno delle staffe quadre che conferisce al tasso moltiplicatore per ogni gene.

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