Banco da lavoro di Spindel. Acquisire un metodo per l'identificazione delle specie in tutti i domini della vita utilizzando analisi multiplex.
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Banco da lavoro di Spindel. Classifica e riepilogo

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Banco da lavoro di Spindel. Descrizione

Il thindel è un approccio alternativo per l'identificazione biologica basata sulla lunghezza delle regioni del gene ribosomal RNA (RRNA). In generale, gli allineamenti delle sequenze del gene del RRNA primario provenienti da diverse specie mostrano regioni alternanti di conservazione e variazione del nucleotidica, sia in termini di sostituzioni del nucleotide (comunemente chiamate "SNPS") e di eventi di inserimento / cancellazione (INDEL). La presenza di Industri si traduce in sequenze di diverse lunghezze e introduce lacune nell'allineamento, tipicamente denotato da un trattino "-". Il nostro concetto di identificazione biologica utilizza sequenze di geni RRNA come segue: Le regioni conservate vengono utilizzate per definire i segmenti variabili ("regioni ipervariabili di" Spindel ") in cui una combinazione di lunghezze di sequenza è caratteristica di ciascuna specie (un" profilo di spindel "). Pertanto, ogni specie può essere definita da un profilo numerico unico. In teoria, un'indagine di sole 6 regioni ipervariabili con 20 alleli ciascuna (o 11 regioni con 5 alleli ciascuna) è sufficiente per discriminare tutte le specie eucariotiche sulla Terra, che sono stimate tra 5 e 15 milioni di numeri. In pratica, Spindel è in grado di discriminare il 93,3% delle specie eucariotiche con una bassa variazione intraspecifica e un'elevata risoluzione filogenetica.

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