Riepilogo copertura proteica

Determina la percentuale dei residui nelle proteine
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Riepilogo copertura proteica Classifica e riepilogo

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  • Pacific Northwest National Laboratory
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Riepilogo copertura proteica Descrizione

Protein Coverage Summarcher è un programma avanzato progettato per calcolare la percentuale di residui in ciascuna sequenza proteica che è stata identificata. Il programma richiede due file di input: il primo dovrebbe contenere i nomi delle proteine e le sequenze di proteine (facoltativamente con la descrizione delle proteine) mentre il secondo dovrebbe contenere le sequenze del peptidico e opzionalmente contengono anche il nome della proteina associato a ciascuna sequenza di peptidi. È fornita un'interfaccia utente grafica (GUI) per consentire all'utente di selezionare i file di input, impostare le opzioni e sfogliare i risultati della copertura. Il browser dei risultati visualizza le sequenze di proteine, evidenziando i residui presenti nel file di input del peptidico e fornendo statistiche di copertura della sequenza per ciascuna proteina.


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