Prosat. Toolkit di annotazione residuo proteico
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Prosat. Classifica e riepilogo

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annotazione Plug-in annotazione Annotazione sdk. Annotazione ActiveX. proteina il video di annotazione recuperare proteine analizzare le proteine proteine confrontare Annotazione PDF. Annotazione geometrica. Annotazione semantica Annotazione del grafico molecola proteica Biblioteca di annotazione Processore di annotazione Annotazione dell'immagine Annotazione lessicale-coesione Annotazione semi-automatica annotazione ascoltatore Annotazione ripasosa Debug di annotazione simbolo Annotazione cli. annotazione del testo. creare annotazione Identificazione delle proteine Sintetizzatore proteico. cristallizzazione delle proteine Traslocazione delle proteine Elenco delle proteine Visualizzazione delle proteine annotazione di sequenza Strumento di annotazione Numero annotazione Annotazione rubino annotazione del sito. Visualizza annotazione. estrazione delle proteine Processo di annotazione trascrizione annotazione Strutture proteiche Refinement. Struttura delle proteine Caratteristiche della proteina geometrica. annotazione cromosomica Annotazione genica Annotazione dell'immagine Assaggio dell'annotazione Assegna annotazione Codice annotazione AUDIO ANNOTATION. Valudazione proteica regolata convalidare proteine regolamentate Protein Viewer. residui quadratici non residuo quadratico residuo Meno residuo non quadratico annotazione del discorso annotazione mapper Annotation Analyzer. intuitivi annotazione Analizzare il database proteico Evoluzione delle proteine Test di proteine Disegno annotativo. dicroismo proteico Strutture proteiche Annotazione dei dati Annotazione a base di ontologia Residui proteici Residui aminoacid SVM Builder annotazione funzionale Sistema di annotazione di cDNA. valutare il complesso di proteine Pronostico complesso di proteine Visualizza il complesso di proteine Percentuale di residui residui di amminoacidi Browser proteico preparare l'annotazione della struttura Banca dati della proteina di Brookhaven Architation Editor. visualizzare le proteine Visualizza il file di proteine Analizzatore di proteine Annotazione del vento mondiale Visualizza annotazione fare annotazione Posiziona l'annotazione Mappa annotazione. Controllo dell'annotazione Visualizza sequenze di proteine Sequenze di proteine Viewer Annotazione nucleotide simulare l'evoluzione delle proteine Simulazione dell'evoluzione delle proteine allinea la proteina Visualizza la proteina Proteina della mascotte Annotazione di picco. Interazione proteica rendere le proteine Visualizza i file di proteine Gestire la banca dati proteica VIZUualizer proteico Struttura 3D proteica rimozione delle annotazioni kodak annotazione come giocare Xharbour ActiveX. XLS al DTD Divx Codec Linux. Toshiba Video Controller. Canzoni Karaoke per - Etichetta del CD Zweckform. AutoCAD 2008 down ISO R773 PDF.

Prosat. Descrizione

Il Prosat Toolkit è stato sviluppato per essere un insieme di programmi che consentono di costruire modelli basati su SVM per annotare i residui di amminoacidi nelle sequenze di proteine utilizzando le caratteristiche fornite dall'utente (come i profili PSI-Blot o i profili PSipred). In particolare, il toolkit costruisce funzionalità utilizzando una finestra attorno al residuo ed è dotata di una funzione di kernel specializzata (la funzione del kernel del kernel esponenziale del secondo ordine normalizzato NSOE) insieme alla funzione standard SVM Kernel. Prosat_Learn è il programma per imparare i modelli di classificazione "n" one-Verso-resto, dove n è il numero possibile di annotazioni. Può anche imparare un modello di regressione vettoriale di supporto per prevedere un valore del punto flottante. Utilizzo Promat_learn prosat_predict è il programma per prevedere l'annotazione per ciascun residuo dai modelli costruiti e in uscita a L Xn Dimension Profile, emettendo il punteggio da ciascuno dei n Poggiano i modelli SVM per ciascun residuo di amminoacidi e L è la lunghezza della sequenza proteica. In caso di un modello di regressione, n = 1. Utilizzo Prosat_ledict. Ingresso Prosat_ledict ha tre parametri richiesti: - File di prova: il file di test fornisce l'elenco delle caratteristiche della sequenza per cui dobbiamo prevedere i profili di annotazione. È simile al file di input utilizzato in prosat_learn tranne che non contiene i nomi dei file di annotazione True, poiché stiamo prevedendo lo stesso. - File del modello: il file del modello è il file del modello emerso da promat_learn - File di predizione: il file di previsione fornisce il percorso e il prefisso delle previsioni di uscita sotto forma di profili di annotazione. Uscita L'uscita consiste in un insieme di annotazioni e profili previste, che non sono altro che le previsioni SVM da ciascuno dei modelli SVM "NUM ELEMENT".

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