Proporzionale Analisi dei proteomici di Shotgun quantitativa semplificata.
Scarica ora

Proporzionale Classifica e riepilogo

Proporzionale Tag

Analizzare proteomica post processor Analisi delle proteomiche Proteomica Proteomica quantitativa Analisi dei dati delle proteomiche DATI DI PROTEOMICS. elaborazione dati direttore di proteomica dati Gestisci i dati delle proteomiche Proteomico quantitativo Etichettatura enzimatica enzimatico Proteomica a base di spettrometria Shootgun Screensaver. shotgun. Simulazione dei dati delle proteomiche simulare i dati di proteomica Genoma quantitativo analizzatore di dati proteomici quantitativo analisi quantitativa Analisi quantitativa del rischio

Proporzionale Descrizione

PRORATA è una semplice applicazione progettata per automatizzare l'elaborazione e l'analisi dei dati per la proteomica dei fucili quantitativi. La proteomica dei fucili quantitativi tenta di stimare l'abbondanza di proteine nelle cellule di trattamento relative alla loro abbondanza nelle celle di riferimento. In tali esperimenti, le celle di riferimento sono etichettate con isotopi stabili tramite etichettatura metabolica, etichettatura enzimatica o etichettatura chimica, e sono mescolate con le cellule di trattamento in quantità equivalenti. Dopo la proteolisi, i campioni vengono analizzati con spettrometria di massa cromatogramma liquido multidimensionale-tandem. Gli spettri di massa tandem acquisiti vengono utilizzati per identificare la sequenza di amminoacidi e le modifiche post-traduzioni di peptidi proteolitici. PRORATA prende i risultati di identificazione del peptide e i dati spettrali di massa come input. A questo punto, Prorati accetterà solo l'output dal programma DTAselect come risultato di identificazione e i dati spettrali di massa nel formato MZXML. PRORATA eseguirà tutti i passaggi per stimare i rapporti di abbondanza proteica e i loro intervalli di confidenza. I passaggi includono: estrazione di cromatogrammi di ioni selezionati, rilevamento di picchi cromatografici, stima dei rapporti di abbondanza del peptidica e stima dei rapporti di abbondanza proteica. I risultati da ciascuno di questi passaggi possono essere verificati manualmente tramite l'interfaccia utente grafica PRORATA.

Proporzionale Software correlato