Organizzatore del genoma virale

Browser genoma da utilizzare tramite Java
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Organizzatore del genoma virale Classifica e riepilogo

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  • Viral Bioinformatics
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Organizzatore del genoma virale Descrizione

Organizzatore del genoma virale o VGO creato per essere un browser genoma basato su Java facile da usare. Può essere utilizzato per visualizzare informazioni su un genoma, compresi i suoi geni, gli ORF e i codoni iniziali / stop. Può anche essere utilizzato per eseguire una ricerca di espressioni regolari, una ricerca di motivi fuzzy e una ricerca di massa di massa. Poiché VGO parla con il nostro database di sequenze del genoma (VOC) può essere utilizzato per confrontare i genomi. Caratteristiche principali: Visualizza geni e previsto orfs in una o una serie di genomi. Display Start and Stop Bdons all'interno della sequenza Cerca sequenze all'interno di Genomes usando espressioni regolari; E.G GGATCC o TTTTT T usando un modello di ricerca fuzzy; per esempio. GGATCC che consente una mancata corrispondenza per i geni con il più alto in composizione Utilizzare una GUI per selezionare ed estrarre regioni di un genoma Visualizza ortologie in una serie di genomi usando la GUI per selezionare un gene in un altro genoma visualizza una trama di composizione nucleotidica. cerca il più lungo oligonucleotide condiviso tra una serie di genomi non allineati Cerca nel genoma tradotto per le partite a Peptidi Spect di massa Visualizza graficamente i dati da altri programmi in cima al display del genoma


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