ModelTest. Uno strumento per selezionare il modello più adatto alla sostituzione del nucleotidica
Scarica ora

ModelTest. Classifica e riepilogo

ModelTest. Tag

Sostituzione dell'URL selezione Sostituzione del testo. sostituzione Proporzione nucleotidica Sostituzione trichVIEW. Sostituzione cifra CIFHERS SHIFT-SOSTITUZIONE Sequenza nucleotidica Nucleotide Sequence Manager. nucleotide Sostituzione parziale Sostituzione dell'unità Sostituzione monoalfabetica Modello di sostituzione del nucleotide Motivo nucleotidrico Modello di sostituzione complessa Sostituzione del nucleotide Quadro di selezione del modello. probabilità gerarchica Annotazione nucleotide Modello di sostituzione del DNA. Allineamenti nucleotidi Modello DNA sostitutivo Sostituzione sinonimo Sostituzione nonsynonymus. Modello di sostituzione polimorfismi nucleotidi. mutazione del nucleotide frazione nucleotidica

ModelTest. Descrizione

ModelTest è un software avanzato e affidabile di software sviluppato per servire ingegneri genetici nel determinare le differenze tra i modelli di sostituzione del DNA utilizzando test di ipotesi gerarchici per generare i risultati. Interfaccia della riga di comando L'applicazione è abbastanza complessa, poiché è pensata per gli utenti esperti con una solida conoscenza di base in genetica e computer, in particolare dal momento che non fornisce agli utenti una GUI, in esecuzione solo attraverso l'interfaccia della riga di comando, che può renderlo abbastanza impegnativo per i novizi. Nondimeno, il ModelTest non richiede l'installazione, quindi è sufficiente eseguire gli utenti semplicemente rilasciare il file eseguibile su un'istanza aperta del prompt dei comandi e premere il tasto Invio, che a sua volta rivelerà le funzioni del programma insieme a una breve spiegazione dei comandi disponibili. Funzioni e parametri di esecuzione ModelTest è destinato a lavorare con i file generati da PAUP * che contengono le informazioni genetiche richieste, nonché i file che comprendono i punteggi del registro RAW con stime dei parametri per i modelli valutati. Nella parte opposta, l'utilità genera una descrizione dei test del rapporto di probabilità che sono stati condotti e i loro corrispondenti valori P, le informazioni che vengono quindi interpretate e assegnate un modello appropriato. I modelli supportati sono elencati nell'interfaccia della riga di comando, incluso JC (Jukes e Cantor), TRNEF (Tamura-Nei con frequenze di base uguali), TIM (modello di transizione), GTR (General Time Reversible), F81 (Felsenstein) e molti altri . Allo stesso tempo, gli utenti possono funzionare con un set specifico di funzioni, esemplificato nella finestra principale per renderli più facili da capire e impiegare. Come tale, gli utenti possono determinare il livello di debug (-d), il livello alfa (-a), il numero di taxa (-t), attivare la modalità calcolatrice LRT (-L), determinare l'intervallo di confidenza per la media (-w) o utilizzare BIC piuttosto che AIC per tutte le future operazioni (-b). Uno strumento completo per determinare il modello di sostituzione corretto Per concludere, il ModelTest è un'applicazione efficiente sviluppata per i professionisti che lavorano nel campo della genetica, offrendo loro i mezzi per confrontare i modelli di sostituzione del DNA, aiutando così gli utenti a decidere i loro dati.

ModelTest. Software correlato