Logobar.

Visualizza loghi di sequenza proteica con questo strumento.
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Logobar. Classifica e riepilogo

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  • Rating:
  • Licenza:
  • GPL
  • Nome editore:
  • Thomas BYrglin
  • Sistemi operativi:
  • Windows All
  • Dimensione del file:
  • 115 KB

Logobar. Tag


Logobar. Descrizione

LODOBAR è un software utile e facile da usare appositamente progettato per aiutarti a visualizzare i loghi di sequenza di proteine. Con questa applicazione è possibile generare loghi di sequenza di proteine da più allineamenti di sequenza sul proprio computer, e riceverai un file di output aggiuntivo che mostra l'incidenza dell'aminoacido in ogni posizione del più allineamento della sequenza. Caratteristiche principali: La frequenza dei residui in particolare posizioni è rappresentata con barre colorate. Gli amminoacidi possono essere collocati in gruppi (ad esempio, per avere aminoacidi simili nello stesso gruppo) secondo la scelta dell'utente. Le barre possono essere ordinate in base ai gruppi, quindi gli aminoacidi simili saranno posizionati insieme nel grafico a barre. Le lacune sono prese in considerazione e visualizzate anche nel logo. Le modifiche al parametro su un allineamento di sequenze multiple caricato vengono visualizzate rapidamente poiché LODOBAR è un'applicazione Java in esecuzione sul tuo computer locale.


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