IcplQuant. Quantificare i peptidi con etichetta ICPL con questo strumento.
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IcplQuant. Descrizione

ICPLLQUANT è una nuova suite software sviluppata appositamente per quantificare con precisione i peptidi con etichetta ICPL sul livello MS durante gli esperimenti di impronte digitali LC-MALDI e Peptide. Un grande collo di bottiglia in proteomica quantitativa rimane la disponibilità per un potente software per valutare automaticamente i dati grezzi. In caso di tecnologia ICLP quadruplex è necessario rilevare i quadruplitti (ICPL0, ICPL4, ICPL6 e ICPL10 etichetta) in modalità MS. Il secondo passo è la determinazione dei rapporti dei quattro peptidi quadruplo. In un terzo passaggio almeno uno dei quattro peptidi in ciascun quadruplet deve essere selezionato per l'identificazione della sequenza MS / MS per la sequenza. Caratteristiche principali: quantificazione di tutti i moltiplet correggono per le impurità isotopiche dei reagenti. Preparazione di un elenco precursori contenenti peptidi con i fattori di regolazione definiti dall'utente per l'analisi MS / MS. Mascot .dat file parser Fusione delle informazioni di quantificazione e informazioni di identificazione Elenchi di uscita proteina e peptidica in formati aperti, facilmente accessibili per i programmi di data mining Visualizzazione visiva dei profili LC Computation dei rapporti di quantitazione proteica (con stima standard di deviazione) Esportazione di risultati a file, Excel e ai database Ulteriore sostegno in corso: fornitore termo-elettrone / finnigan; Orbitro; Pacchetto software Xcalibur (file .RAW)

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