Dnassist. Un programma per la modifica e l'analisi dei dati di sequenza di biologia molecolare
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Dnassist. Classifica e riepilogo

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Dnassist. Descrizione

Leggi la carta su Dnassist in Bioinformatica Vedi il capitolo del libro su Dnassist DN Assist fornisce Un'interfaccia intuitiva e singola all'interno di cui sono i file di sequenza visualizzato, modificato e analizzato. Diverse finestre editor potrebbero essere aperte, e l'utente può funzionare in una qualsiasi di queste finestre semplicemente portando in cima. La finestra dell'editor è simile a un processore di parole La finestra e le sequenze possono essere inserite dalla tastiera, selezionata con il puntatore del mouse, copiato, tagliato e incollato da e verso il Appunti, trascinarsi e cadere all'interno dello stesso o ad altro editor Windows e ricerche di testo eseguite. Anche le finestre possono essere cascata, piastrellata o ridotta al minimo. L'utente può personalizzare il display in Windows editor selezionando il carattere, la dimensione del carattere e la lunghezza della linea. UN la sequenza viene analizzata semplicemente portando una finestra editor in alto, e selezionando l'analisi richiesta dal menu. Tutte le analisi Can anche essere eseguita su una regione selezionata della sequenza in un editor finestra. Facendo clic con il tasto destro del mouse fornirà un contesto sensibile al mouse menù popup. Questo dà all'utente un comodo collegamento alla maggior parte del menu Oggetti. DNA ssist fornisce anche una barra di marcia con pulsanti rappresentare azioni comuni. Le analisi disponibili su DN Assist include: la conversione di una sequenza di DNA tra la circolare e forme lineari la conversione del DNA a un RNA o una sequenza proteica La conversione di RNA a un DNA o una sequenza proteica traducendo una sequenza di DNA alla sequenza di amminoacidi in uno, tre o tutti e sei i fotogrammi Individuazione dei telai di lettura aperti (ORFS) in una sequenza di DNA Individuazione dei modelli di sequenza specifici in una sequenza (questo consente Wildcards, disallineamenti e lacune) Esecuzione di un'analisi dell'enzima di restrizione con un set definito di enzimi Esecuzione di un'analisi del promotore del DNA con specificato fattori di trascrizione Individuazione dei segnali di posizionamento del nucleosoma forte nel DNA Esecuzione di più allineamenti di DNA, RNA o Proteine ottenendo il peso molecolare di un acido nucleico o proteina ottenendo la temperatura di fusione di un oligonucleotide Calcolando il PI di una proteina Calcolo del profilo idrofilo, idrofobico o antigenico di una proteina ottenendo il coefficiente di assorbimento molare e E0,1% di un acido nucleico o di una proteina ottenendo il nucleotide o la composizione degli amminoacidi di a acido nucleico o proteina dn assist porta tutti questi Caratteristiche insieme in un Windows® strettamente integrato applicazione. Questo dà all'utente la libertà di lavorare nel Intuitivo IEAE di DN Assist come in una lavorazione di parole ambiente e avere una batteria ampia e potente di Caratteristiche analitiche con un clic del mouse. Il risultato di un L'analisi viene visualizzata in una finestra di risultato e può essere stampata, salvata su disco o copiato e incollato in applicazioni di terze parti. Salvato o I risultati copiati conservono il formato in cui sono stati visualizzati. Il L'utente può selezionare da una vasta gamma di opzioni di formattazione. Questo include la visualizzazione delle sequenze come linee continue di testo o come Blocchi di testo. È possibile visualizzare uno o entrambi i fili di una sequenza di DNA. La posizione dei numeri di sequenza relativa alla sequenza può anche essere specificato, così come il font di viso e dimensioni. L'utente può anche Specificare i colori delle scatole utilizzate per indicare identiche o conservate Aminoacidi in più allineamenti. È quindi possibile personalizzare DN Assist alla preferenza di ciascun utente. Il display Le opzioni di formattazione e le opzioni della finestra dell'editor vengono salvate in Registro di sistema quando l'utente esce dal DN Assist . In un utente multiplo Ambiente, queste impostazioni sono associate al nome in cui L'utente è stato registrato su Windows®. Ciò consente a molti utenti di utilizzare DN Assist su un singolo computer, in cui ogni utente avrà Preferenze personalizzate che non sono cambiate da quelle dell'altro utenti.

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