Analisi e visualizzazione di Segnalazione Savi Analizza e visualizza i segnali cellulari e le reti realizzate con componenti cellulari.
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Analisi e visualizzazione di Segnalazione Savi Descrizione

Visualizzazione delle interazioni proteiche-proteine e ligando-proteina come grafici (reti), in cui le biomolecole sono rappresentate come nodi e le loro interazioni sono rappresentate come collegamenti, è un approccio promettente per integrare i risultati sperimentali da diverse fonti per ottenere una comprensione sistematica dei meccanismi molecolari che guidano il fenotipo cellulare . L'emergere di reti di segnalazione su larga scala fornisce un'opportunità per l'analisi statistica topologica, mentre la visualizzazione di tali reti rappresenta una sfida. Salvi implementa i metodi standard per calcolare il clustering, la distribuzione e la rilevazione e il rilevamento, nonché la visualizzazione, dei motivi di rete. Inoltre, Savi genera un sito Web completo dai set di dati di rete in formato testo. Savi contiene uno strumento chiamato PathwayGenerator. Questo strumento crea mappe di connessione come pagine Web da tabelle di grandi dimensioni che descrivono interazioni di segnalazione cellulare. Savi può anche creare reti da elenchi di nomi geni / proteine. La versione 2.5 può includere aggiornamenti non specificati, miglioramenti o correzioni di bug.

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