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3DiCSI è un piccolo, semplice, facile da utilizzare l'applicazione sviluppata per aiutare a interpretare i dati Chemical Shift Imaging (CSI). Esso combina la visualizzazione dei dati, l'elaborazione spettrale, la localizzazione e la stima spettrale, quantificazione spettrale unitamente procedure di analisi multivariata, ad esempio Analysis Principal Component (PCA) e vincolato non negativo Matrix Factorization (CNMF). In particolare, CNMF fornisce un modo efficace per recuperare modelli spettrali sottostanti che sono fisicamente significativa. Caratteristiche principali: Input Data e visualizzazione: importazione automatica dei 1D / 2D / 3D CSI dati grezzi provenienti da Philips, GE, Siemens e Bruker scanner. Qualsiasi tipo di dati sconosciuto può essere importato inserendo manualmente i parametri. Eventuali ulteriori formati sono supportati anche tramite plug-in di terze parti. dati CSI e le immagini di riferimento anatomici sono registrati e visualizzati nella stessa finestra. Ciascun voxel viene visualizzato in una finestra separata, la sua posizione spaziale chiaramente visualizzate nelle tre finestre delle immagini ortogonali. ricostruzione di immagini 3D da immagini in un unico orientamento. Multi-dimensionale spettrale Data Processing: fase costante e correzione di fase lineare. temporale di filtraggio (Lorentzian, gaussiana, o combinati). smoothing spaziale (Hamming, Cosine, Fermi). Baseline correzione. acqua soppressione. regolazione PPM origine e riempimento zero. Lipid soppressione. Peak allineamento. Batch Processing: Sequenza di elaborazione misure può essere registrata in un file macro e applicato al set di dati CSI. Lo stesso file macro può essere applicata ad una serie di prove in modalità batch. spettrale Localizzazione: tempo reale mouse facilitato voxel interattivo spostando nelle 3 dimensioni. della media dei multipli voxel selezionati. spettrale stima di un utente disegnato regione 2D / 3D di interesse. Multi-variata analisi spettrale: Analisi delle Componenti Principali (PCA) per l'utente definito regione spettrale e ROI, per identificare componenti principali (PC) per le fonti di variazione contenute nel set di dati CSI. procedura iterativa allineamento picco PCA-based per rimuovere variazioni di frequenza e di fase. vincolata non negativo Matrix Factorization (CNMF) metodo per recuperare i modelli spettrali e loro distribuzioni spaziali che sono fisicamente significativa. spettrale Quantificazione: metabolica mappa generazione che utilizza l'integrazione zona e PCA. Mappa generazione per il rapporto di picco e per le regioni definite dall'utente. quantificazione assoluta di concentrazione dei metaboliti utilizzando spettro di riferimento. regolazione scala della Mappa che consentano il confronto tra i diversi insiemi. integrazione spettrale con correzione al basale controllato dall'utente. Uscita Data: Varie opzioni di output dei risultati, quali la relazione in formato HTML, fetta di CSI e l'immagine stampare, visualizzazione funzione copia e incolla, spettrale ascii / binario esportazione, metaboliche immagine esportazione. Programma estensibilità: Plug-in meccanismo per supportare un modulo dati importazione CSI sviluppato da terze parti.

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