Strumento magico

strumento di imaging del genoma microarray e strumento di clustering
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Strumento magico Classifica e riepilogo

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  • Rating:
  • Licenza:
  • GPL
  • Nome editore:
  • Laurie Heyer
  • Sistemi operativi:
  • Windows All
  • Dimensione del file:
  • 17.1 MB

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Strumento magico Descrizione

Magic Tool è un'applicazione Windows basata su Java il cui scopo è quello di aiutarti a analizzare i file TIFF di Microarray del DNA e il processo di elaborazione dei dati di ibridazione comparativa (chip di vetro) e informazioni affolicabili. Affissione a Modeyou può usufruire del fatto che lo strumento è disponibile in un pacchetto portatile e distribuirlo direttamente sul tuo computer senza dover passare attraverso un processo di installazione. Inoltre, il tuo registro di Windows non viene gonfiato di voci non necessarie. È possibile memorizzarlo su qualsiasi unità flash USB o altri dispositivi e prenderti. L'utensile interfaccemmagico utente adotta un layout pulito che consente di aggiungere file nell'ambiente di lavoro utilizzando il pulsante Sfoglia integrato (non c'è supporto per il trascinamento del trascinamento). È possibile visualizzare l'anteprima del contenuto del file, esploralo utilizzando le funzioni Zoom avanti e out, adatta all'immagine sullo schermo, impostare i punti in alto a sinistra e destra, specificare la riga inferiore, nonché regolare il numero di righe e colonne. Definizione di nuovi progetti L'applicazione utilizza progetti per la memorizzazione dei dettagli e delle impostazioni di configurazione sui dati importati e sui calcoli eseguiti. I progetti possono essere salvati e aggiunti per attività di modifica future. È possibile importare articoli con diversi formati di file (TXT, JPEG, TIF, GIF, Grid, Info o Flag), aggiungere il contenuto di un'intera cartella, inserire file nella cartella del progetto e aggiornare il progetto (le regolazioni vengono applicate automaticamente), Oltre a caricare le coppie di immagine del tiff rosso e verde. Inoltre, è possibile caricare l'elenco dei geni e creare una nuova griglia o aggiungi uno salvato. Quando si tratta di creazione della griglia, è possibile inserire il numero totale di griglie nel file TIFF, specificare l'orientamento a punti all'interno delle griglie (orizzontalmente o verticalmente), regolare il contrasto per aiutare a illuminare i punti deboli, centrare la griglia corrente, immettere le informazioni sulla posizione della griglia Utilizzando tre scatti (impostazione di punti in alto a sinistra e destra e riga inferiore), regolare la griglia per centrare i punti, creare più griglie e bandiera i punti problematici (opzionalmente). Distinguere il segnale dal rumore, generare una serie di cluster e uno strumento moremagico offre la possibilità di distinguere il segnale dallo sfondo e generare file di espressione. È possibile scegliere tra diversi metodi per distinguere il segnale da sfondo, cioè il cerchio fisso o adattivo, opzione di crescita della regione seminata (progettata per trovare il segnale per ogni punto in base alla distribuzione del segnale), o metodi di rapporto (primo piano e sfondo rosso o verde Primo piano e sfondo per determinare il rapporto per ogni funzione sul microarray). Inoltre, puoi ripetere diversi passaggi per le condizioni sperimentali nel tuo studio, manipolare i dati (trasformare, normalizzare, limitare dati, filtro o scramble), aggiungere informazioni geni al file di espressione, filtrare i tuoi dati rimuovendo i geni non necessari, calcola le dissomiglianze (misurando Le differenze tra ogni paio di modelli di espressione genica), generano una serie di cluster, accumulando un elenco di compiti da eseguire in sequenza e confrontare le conseguenze delle diverse scelte per quantificare, confrontare e raggruppare lo stesso set di dati grezzi. Bottom LineAlll In tutto, lo strumento magico dimostra di essere uno strumento affidabile che può essere utilizzato come uno strumento educativo potente per aiutare gli studenti a esplorare e elaborare i file TIFF del DNA Microarray. Recensito da Ana Marculescu, ultimo aggiornamento il 20 ottobre 2014


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