Il nome SHIAt sta per Shannon Heterogeneity nello strumento di allineamento. SHIAT genera trame di variazione del sito-saggio lungo un allineamento di sequenza (compresa l'entropia Shannon e le misure di distanza di hamming). Questa applicazione fornisce un'interfaccia grafica intuitiva per il calcolo simultaneo di tre misure di variazione del sito in allineamenti al DNA o all'RNA. L'indice di informazioni di Shannon, la distanza di hamming e (frequenza di 1 consenso) sono calcolati e visualizzati in una serie di grafici grafici. Pił allineamenti possono essere importati e confrontati e un pannello View di dati consente una facile copia e-incollando in applicazioni esterne. Quattro misure sono implementate: - Entropia di informazioni di Shannon (per posizione) - 1- (frequenza di consenso) (per posizione) - 1- (indice H eterozigosi h) (per posizione) - Distanza di hamming (riassunta a coppie attraverso l'allineamento)
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