GCUA: analisi di utilizzo del codone generale

Analisi del gene semplificata.
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GCUA: analisi di utilizzo del codone generale Classifica e riepilogo

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GCUA: analisi di utilizzo del codone generale Descrizione

GCUA: l'analisi di utilizzo del codone generale è una pratica applicativa a base di Java, facile da usare, appositamente progettata per eseguire varie attività utilizzate per la valutazione dell'uso del codone in un insieme di geni. Puoi farlo fare alcune cose semplici come calcolare il numero di osservazioni di un particolare codone in un gene. Oppure puoi fare la stessa cosa per il set di dati combinato. Puoi anche guardare le frequenze di utilizzo degli amminoacidi (di nuovo per ogni gene o per il set di dati nel suo complesso). Il programma produce anche una matrice a distanza basata sulla somiglianza dell'utilizzo del codone nei geni. Tuttavia, la caratteristica più importante del programma è la sua capacità di utilizzare l'analisi multivariata per esaminare la variazione dell'uso del codone tra i geni. Anche se è popolare dire che un organismo ha un particolare utilizzo del codone, ora è noto che i geni di organismi potrebbero avere più di un modello di utilizzo del codone e di solito è solo utilizzando un metodo di analisi multivariato che è possibile accertare i tipi di variazione contenuta all'interno dei dati.


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