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jmotu. Classifica e riepilogo
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- Licenza:
- Freeware
- Nome editore:
- Mark Blaxter
- Sito web dell'editore:
- http://www.nematodes.org/
- Sistemi operativi:
- Mac OS X
- Dimensione del file:
- 7.5 MB
jmotu. Tag
jmotu. Descrizione
Software per i dati di sequenza del DNA del codice a barre del clustering in unità tassonomiche operazionali molecolari (Motu) JMoTU è un pacchetto software gratuito e facile da usare per i dati della sequenza del DNA del codice a barre del clustering in unità tassonomiche operazionali molecolari (Motu). JMoTU può elaborare i set di dati di grandi dimensioni e utilizza una serie di passaggi di filtraggio per ridurre al minimo il numero di esatti allineamenti globali che devono essere eseguiti. Quando si calcolano le distanze a coppie, JMoTU ignora le lacune e conta solo le partite errate del nucleotide, rendendola relativamente robusta per sequenziare errori causati da esecuzioni di omopolimero. Il clustering viene effettuato utilizzando un algoritmo avido che non dipende dall'ordine di sequenza di input. JMoTU è stato testato sui set di dati GRUE di circa 50.000 sequenze di input e possono cluster cluster più grandi dataset preformando precluster dei sottoinsiemi di dati prima di combinarli per un'analisi globale.
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