Vitefit. Un programma open source per la caratterizzazione delle strutture secondarie delle proteine
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Vitefit. Classifica e riepilogo

Vitefit. Tag

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Vitefit. Descrizione

Un programma open source per la caratterizzazione delle strutture secondarie proteiche Vitifit è un software che fornirà una descrizione efficiente dei motivi strutturali basati su semplici ipotesi geometriche. L'algoritmo implementato in vitifit determina le distanze orientative dei piani peptidi consecutivi utilizzando i basamenti di sovrapposizione basati su quaternion combinati con il teorema delle Chasles. Questo approccio consente di descrivere gli elementi strutturali in termini di parametri di movimenti a vite e eliche locali. Requisiti: · Python. · Numpy. · Scientificython. · MMTK. · NetCDF. Cosa c'è di nuovo in questa versione: Correzioni di bug: · L'installazione non funzionava correttamente. Miglioramenti: · Ingressi e uscite più semplici · Numerazione dei residui PDB nei file di output. Questo aiuta a confronto con altri metodi.

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