Viewer Gambit. Un banco di lavoro del visualizzatore e dell'analisi della piattaforma multipiattaforma per i dati di sequenziamento della prossima generazione
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Viewer Gambit. Classifica e riepilogo

Viewer Gambit. Tag

visualizzare sequenza analizzare analisi della sequenza Visualizzatore di dati sequenziali. Analizza il cromosoma

Viewer Gambit. Descrizione

Un workbench del visualizzatore e dell'analisi della piattaforma multipiattaforma per i dati di sequenziamento della prossima generazione Il Viewer Gambit è un'applicazione di un'interfaccia utente grafica (GUI) grafica che mira ad aiutarti con l'analisi della sequenza. Il software Gambit Viewer sfrutta le funzionalità di indicizzazione del formato di allineamento della sequenza di BAM (in modo equo standardizzato che consente un rapido accesso a Genomic dati, con tempo di avvio minimo e ritardo di ri-rendering. Il Viewer Gambit supporta anche una varietà di formati di annotazione (Bed, GFF, GFF3, VCF) "Out-of-the-Box" per la visualizzazione di annotazioni di geni / regione e voci SNP.The Gambit Viewer è attualmente "Plugin-Aware" Per quanto riguarda il supporto del formato, è possibile aggiungere il supporto per i nuovi formati senza dover modificare / aggiornare il programma principale stesso. L'analisi di sequenza di sequenza richiede attualmente competenze specializzate e sta rapidamente diventando un collo di bottiglia. Le esigenze di analisi dei laboratori di biologia più piccoli possono essere serviti se il software di visualizzazione integra funzionalità analitiche essenziali. Tale funzionalità include il PCR Primer Design per supportare esperimenti di convalida SNP candidati; Collegamento a database comuni; Esportazione dei dati da regioni specifiche del cromosoma per analisi dettagliate e focalizzate. Il visualizzatore di gambit sarà presto "plugin-consapevole" rispetto agli strumenti analitici per fornire funzioni così integrate. Un vantaggio dell'implementazione del sistema di analisi tramite Plugin è che chiunque abbia le competenze di programmazione può includere facilmente le proprie caratteristiche personalizzate: supporto per nuovi formati di file, metriche aggiuntive o visualizzazioni personalizzate. Un altro vantaggio è che gli utenti non devono aggiungere ogni plug-in. Sarai in grado di personalizzare il visualizzatore Gambit per essere leggero o completamente funzionale come richiedere le tue esigenze. Requisiti: · Java.

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