UNIVERSALE Strumento di traduzione del codice di biologia dei sistemi
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codice traduzione Biologia

UNIVERSALE Descrizione

Universal è uno strumento Giava gratuito e gratuito e open source-server per la generazione di codice modello matematico da una varietà di formati di input a uno dei diversi formati di output. Ad esempio, i formati di input, un file piatto delimitato da virgola vengono letti da Universal e convertiti in un albero Biologia Biologia Markup (SBML) in memoria sul server. Dall'albero SBML, il codice del modello viene generato nel linguaggio di programmazione C (GSL, meridiane o un modulo C ottava) o in MATLAB M-code, ottava M-code o Scilab. Inoltre, poiché è estensibile, sono stati sviluppati un numero di moduli plugin, ad esempio, SBML al formato DOT graphviz per la visualizzazione della rete. Universal include sia un'interfaccia utente grafica (GUI) che un motore di generazione di codice (CGE). La GUI è scritta in Objective-C / Cacao mentre la CGE è basata su Java.

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