Snapp.

Analisi dei dati SNP e AFLP: analisi completa coalescente senza quegli alberi geni pesky.
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Snapp. Classifica e riepilogo

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  • Rating:
  • Licenza:
  • LGPL
  • Nome editore:
  • SNAPP Team
  • Sistemi operativi:
  • Mac OS X
  • Dimensione del file:
  • 15 MB

Snapp. Tag


Snapp. Descrizione

SNAPP è un'implementazione gratuita e open source di un metodo basato su MCMC per l'inferno di specie (popolazione) alberi e demografici da dati SNP non collegati. SNAPP (pacchetto SNP e AFLP per analisi filogenetica) è una suite o strumenti per l'inferenza evolutiva da sequenze molecolari. SNAPP utilizza un formato di input complesso e potente (specificato in XML) per descrivere il modello evolutivo. Ciò ha vantaggi in termini di flessibilità in quanto gli sviluppatori di Snapp non devono provare e prevedere ogni analisi che i ricercatori potrebbero desiderare di eseguire e fornire esplicitamente un'opzione per farlo. Tuttavia, questa flessibilità significa che è possibile costruire modelli che non si comportano bene sotto il quadro di inferenza di Markov Catena Monte Carlo (MCMC) utilizzato. Snapp è multipiattaforma e funziona su Mac OS X, Windows e Linux. I binari per le piattaforme Windows e Linux sono disponibili nella homepage del progetto. Istruzioni per l'installazione di come installare e utilizzare l'utilità Snapp sul tuo Mac sono disponibili qui.


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