Pyrx. Visualizza dati molecolari con questo strumento
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Pyrx. Classifica e riepilogo

Pyrx. Tag

analizzare analizzatore molecola Molecule Viewer. analizzatore del bersaglio del farmaco Processo di scoperta del farmaco

Pyrx. Descrizione

Visualizza i dati molecolari con questo strumento Pyrx è un'applicazione di screening virtuale facile da usare appositamente progettata per la scoperta del farmaco computazionale che può essere utilizzata per schermare le librerie di composti contro potenziali bersagli di droga. Pyrx Abilita i chimici medicinali di eseguire lo screening virtuale Formare qualsiasi piattaforma e aiuta gli utenti in ogni fase di questo processo - dalla preparazione dei dati alla presentazione del lavoro e all'analisi dei risultati. Mentre è vero che non esiste un pulsante magico nel processo di scoperta del farmaco, Pyrx include la procedura guidata di docking con un'interfaccia utente facile da usare che lo rende uno strumento prezioso per il design di farmaci assistito da computer. Pyrx include anche la funzionalità chimica del foglio di calcio e il potente motore di visualizzazione essenziale per il design razionale dei farmaci. Cosa c'è di nuovo in questa versione: · Aggiunto Salva come strumento Valori separati da virgola (CSV) per le tabelle del database. · Aggiunta funzione di tracciamento delle tabelle del database. Questa funzione è accessibile tramite un pulsante della barra degli strumenti in tabelle Tab Tab. Per impostazione predefinita, si apre la finestra di dialogo della tabella della tabella in cui viene visualizzata una trama bar di energia vincolante contro ligando (indice). Se è stata aperta Bioassay Pubchem utilizzando il pulsante Apri CVS, questo widget controllerà anche se c'è una colonna di risultato in quella tabella, e in caso affermativa, le barre di colore corrispondono a rosso "attivo" rosso e barre corrispondenti a blu "inattivo" . · Campo di forza predefinito modificato per la minimizzazione aperta di energia Babel da UFF a MMFF94. · Impostazione predefinita modificata per il numero massimo di valutazioni energetiche (parametro algoritmo generico in AutoDock) da medio (GA_NUM_EVALS = 2500000) a breve (GA_NUM_EVALS = 250000). · Aggiunto la finestra di dialogo Progresso di sottomissione del lavoro AutoDock PBS. · Risolto un bug che stava causando problemi durante la visualizzazione di superfici molecolari per le conformazioni ancorate. · Aggiunta una finestra di dialogo per selezionare la conformazione alternativa quando si esegue il file di macromolecule (PDBQT) per AutoDock. · Abilitato l'agente di qualità degli ambiti che può essere utilizzato per ottenere un segnale di bug e commenti da un utente. · Aggiunta l'opzione Annulla per i servizi Web Autogrid. · Residui flessibili implementati per AutoDock. Questa funzione può accedere selezionando residui / i sotto Navigator-> Molecole e facendo clic con il tasto destro del mouse su di essi. Selezionare AutoDock -> Residui flessibili per creare cartella _FLEX in Navigator -> AutoDock -> Macromolecole con recettore PDBQT e FLEX.PDBQT. Tutto attracco a questo recettore viene quindi fatto con questo residuo flessibile / i. · Aggiornato Python alla versione 2.6 e ETS a 3.4.0.

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