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Mpex. Classifica e riepilogo

Mpex. Tag

proteina studia topologia Topologia delle proteine Proteina a membrana proteina di studio

Mpex. Descrizione

Strumento per esplorare la topologia delle proteine della membrana MPEX è uno strumento gratuito e facile da usare per esplorare la topologia e altre caratteristiche delle proteine della membrana mediante piazze di idropatia basate su principi termodinamici e biologici. MPEX è progettato per l'esame delle sequenze di proteine della membrana che utilizzano metodi di stampa idroatica popolarizzati da Kyte e Doolittle (1982). Cioè, si basa sull'analisi della finestra scorrevole che rappresenta una sequenza di amminoacidi come una sequenza di numeri che rappresentano proprietà fisiche o statistiche della sequenza di amminoacidi. La proprietà fisica più comune è l'idropatia, che si basa sulla libera energia del partizionamento di aminoacidi tra acqua e membrana. Questa versione di MPEX utilizza due tipi di scale di idropatia: le scale di partizionamento del residuo intero basato sull'esperimento determinate in questo laboratorio e le scale di partizionamento biologiche basate su sperimenti determinate in collaborazione con il laboratorio di Von Heijne all'Università di Stoccolma. Requisiti: · Java 1.6 o successiva

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