Ligandscout. Applicazione software per la modellazione avanzata del farmacoforo
Scarica ora

Ligandscout. Classifica e riepilogo

Ligandscout. Tag

sovrapposizione molecola Complesso di molecola Generazione di farmacophore farmacoforico overlay Pharmacophore.

Ligandscout. Descrizione

Applicazione software per la modellazione avanzata del farmacoforo Ligandscout è uno strumento software che consente di ottenere rapidamente e in modo rapido e trasparente la farmacofori 3D da dati strutturali dei complessi di macromolecola / ligando in modo completamente automatizzato e conveniente. Gli algoritmi sono scientificamente pubblicati e basati su diversi anni di esperienza nella creazione di Pharmacophore , mentre l'applicazione corrisponde alla tecnologia dell'informazione all'avanguardia. Supporto per vari formati di farmacophora comune come l'esportazione in catalizzatore, Moetm o Phasetm garantiscono la massima interoperabilità alle piattaforme di screening. L'interfaccia utente grafica in 3D completa con livelli di annullamento multipli renderà l'esplorazione del sito attivo e della creazione di farmacophore all'interno del complesso trasparente ed efficiente. L'analisi del sito vincolante, l'allineamento basato su farmacophore e la creazione di farmacophofori di funzionalità condivise sono progettati per rendere lo strumento essenziale di Ligandscout per il design di droga basato sulla struttura in combinazione con lo screening virtuale. Ligandscout funziona su tutti i sistemi operativi comuni. Ciò sono alcune caratteristiche chiave di "Ligandscout":? Interpretazione automatica dei ligandi PDB utilizzando geometrie, dizionari e regole? Interfaccia utente all'avanguardia con grafica 3D avanzata e annullamento della funzione? Vista 2D e vista gerarchica direttamente collegata all'interfaccia 3D? Allineamento rapido delle molecole nella loro conformazione bio-attiva ad altre molecole e farmacofori 3D da diversi ligandi e / o farmacophofori, le caratteristiche condivise farmacofori possono essere derivate per comprendere e modellare la modalità di azione pertinente? Gestione avanzata di co-fattori, ioni, molecole d'acqua e ligandi legati in modo covalente? Pharmacophore Export in catalizzatore (TM), MOE (TM) e Phase (TM) per lo screening virtuale? Ampio controllo dei parametri per utenti più esperti? Percezione avanzata del Ligand PDB e facile correzione manuale durante la modellazione nel sito attivo? Capacità di trattare co-fattori e molecole d'acqua come parte del ligando o parte della macromolecola? Allineamento intuitivo a base di farmacophore di molecole? Supporto per i formati di file più comuni? Gestione sofisticata del file e del repository di siti di rilegatura modificati e archiviati, molecole e farmacoforirequirements:? Almeno 512 MB di RAM (consigliato 1 GB)? Java 1.5 Ambiente runtime? Scheda grafica 3D accelerata hardware (NVIDIA o ATI consigliata) con Limitazioni di supporto OpenGL 1.2: · Prova di 30 giorni

Ligandscout. Software correlato