Imas. Un sistema gratuito per la scoperta della conoscenza in informazioni genomiche
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Imas. Classifica e riepilogo

Imas. Tag

analizzare scoprire genoma Analizza il genoma Visual Analytics. Scoperta del genoma

Imas. Descrizione

Un sistema gratuito per la scoperta della conoscenza nelle informazioni genomiche IMAS (il sistema di analisi multigenomico interattivo) è un sistema analitico visivo gratuito e open source per la scoperta della conoscenza delle informazioni genomiche. IMAS consente agli scienziati genomici di analizzare rapidamente una serie di sequenze genomiche microbiche utilizzando strumenti come Glimmer, Blast, Clustalw, Primer3 e Transterm e visualizzare l'output di questi strumenti in un quadro genomico unificato.IMAS fornisce all'utente uno zoom 1-dimensionale Interfaccia grafica a una sequenza genomica. L'utente può interagire con la sequenza da analizzare per la presenza di regioni di codifica, che possono essere ulteriormente analizzate dall'allineamento della sequenza con i database locali e remoti utilizzando BLAST. I risultati degli esplosioni sono visualizzati in un quadro grafico unificato che consente all'utente di filtrare e selezionare Blast hit di interesse. I successi selezionati possono essere quindi multialograni utilizzando Clusalw e questi multialignamenti vengono visualizzati utilizzando il quadro grafico comune. I multialignments e gli allineamenti a coppie possono essere annotati dall'utente per il riferimento futuro e i report HTML possono essere generati mostrando questi risultati.

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