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Gotaxexplorer. Classifica e riepilogo
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- Licenza:
- Freeware
- Nome editore:
- Max-Planck-Institut Informatik
- Sito web dell'editore:
- http://methmarker.mpi-inf.mpg.de/
- Sistemi operativi:
- Mac OS X
- Dimensione del file:
- 1 KB
Gotaxexplorer. Tag
Gotaxexplorer. Descrizione
Ti permette di fare una classificazione tassonomica GoDaxExplorer è un software gratuito e facile da usare che presenta un nuovo approccio alla genomica comparativa che integra informazioni e famiglie funzionali con la classificazione tassonomica.Gotaxexplorer integra Uniprot, Gene Onology, NCBI Taxonomy, PFAM e intelligente in un unico database. Guantoxexplorer offre quattro diversi tipi di query: · Selezione di set · Confronto tra set di famiglie PFAM · Confronto semantico di serie di GO Termini · Confronto funzionale dei set di prodotti geniQuesto permessi di selezione di insiemi personalizzati di termini GO, famiglie o gruppi tassonomici. Ad esempio, è possibile confrontare organismi o gruppi arbitrariamente selezionati o gruppi di organismi dall'albero tassonomico sulla base della funzionalità dei loro geni. Inoltre, Guantoxexplorer consente di determinare la distribuzione di specifiche funzioni molecolari o famiglie di proteine nella tassonomia. Il confronto dei termini di serie di GO consente di valutare la similarità semantica di due diversi termini Go. Il confronto funzionale dei prodotti geni consente di identificare prodotti geni funzionalmente equivalenti e funzionalmente correlati da due organismi sulla base delle annotazioni di go e di una misura di somiglianza semantica per andare. Questo metodo è indipendente dalla somiglianza della sequenza e quindi in grado di trovare proteine funzionalmente equivalenti o funzionalmente correlate che non sono omologa. Requisiti: · Java 1.6 o successiva
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