GENE-NET. Software che consente di testare ipotesi su strutture genetiche
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GENE-NET. Descrizione

Software che consente di testare ipotesi su strutture genetiche GENE-NET è un software gratuito e facile da usare che ti consente di testare ipotesi sulla struttura genetica degli organismi d'acqua dolce relativi alla geometria della rete fluviale. Gli utenti iniziano a selezionare la rete fluviale sintetica e parametri iniziali della popolazione. La configurazione della rete è caratterizzata dalla lunghezza e dal numero di filiali. Ogni individuo di una popolazione situata sulla rete è caratterizzata dal suo sesso, un ciclo di vita, il suo genotipo e una probabilità di muovere la densità della popolazione. Quindi, Gene-netsimula dispersal e riproduttore lungo la rete fluviale. I dati genetici derivanti dalla simulazione sono disponibili per qualsiasi popolazione situata in qualsiasi momento nel modulo di generazione di Arlequin Format.Network: le simulazioni demografiche vengono eseguite lungo una rete sintetica discretizzata in nodi uniformemente distanziati. Ogni nodo è collegato a uno o due nodi superiori (a monte) e un nodo inferiore (a valle) per consentire la migrazione in entrambe le direzioni. Le caratteristiche dei nodi e della rete fluviale sono calcolate da un modulo di generazione di rete fiume Fractal. Questo modulo ha bisogno di quattro parametri che sono sufficienti per descrivere una rete fluviale frattale: due rapporti di Horton RB e RL, l'ordine massimo della rete del fiume N e un fattore di scala. Il fattore di scala viene utilizzato per moltiplicare il passaggio spaziale (distanza tra due nodi) e generando così reti di dimensioni reali. La posizione precisa di un segmento del flusso all'interno dell'intera rete fluviale può essere identificata classificando la rete. Il sistema di classificazione è il seguente: · Le controduterie sono i segmenti del flusso del primo ordine; · Quando due segmenti di flusso all'interno dello stesso ordine w = mi sono unito, il segmento del flusso risultante da questa confluenza è all'interno di ordine w = I + 1; · Quando due segmenti di flusso All'interno di diversi ordini, w = i e w = j unione, il segmento del flusso risultante da questa confluenza è all'interno dell'ordine w = max (i, j). Questa classificazione può essere messa in equazione matematica e riassumere per equazione. Requisiti: · Java.

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