GAZZA un progetto completo basato su Java che studia le proprietà del DNA e le sequenze proteiche
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proteina studia dna. Sequenza proteica Studia il DNA. Presentazione del DNA

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Un progetto completo basato su Java che studia le proprietà del DNA e le sequenze proteiche Ambiente di investigazione del progetto del genoma automatizzato multiuso è un pacchetto software per la presentazione automatica delle sequenze di DNA e proteine. Informazioni sulla gazza sulla probabilità di codifica della probabilità di un Orf viene visualizzata come un set di 6 attributi. Queste informazioni sono fornite nella grafica CONTIG e nella linea informatica Orf sulla pagina verde. I primi tre attributi devono riflettere le proprietà calcolabili della sequenza, mentre PDM descrive la quantità di prove esterne (tramite ricerche del database) abbiamo circa la funzione della sequenza. Più blu (livello 1) nella casella, più è probabile che ORF sia davvero una sequenza di codifica. · F: (sì / no) La sequenza di codifica potenziale si adatta al profilo di utilizzo del codone di questo organismo (utilizzando una fiducia del 99% di fiducia al chi-square bontà del test di adattamento) · A: (Sì / No) è il + G% della sequenza > 50%, caratteristica della sequenza di codifica in molti organismi · C: (Livello 1, 2, 3 o 4) Qual è il livello di compensazione del G + C nella seconda e terza posizione del codone? La maggior parte degli organismi seguirà un modello sul contenuto di G + C è superiore nella terza posizione "Wagle". · P: (livello 1,2 o 3) indica il miglior livello di prove che abbiamo costituito da una corrispondenza a livello di proteina (ad esempio contro Genpipt, o il colpo di mRNA a livello di proteina / CDNA Hit. · D: (Livello 1, 2 o 3) Indica il miglior livello di prove che abbiamo che consiste in fiammiferi alle sequenze di DNA a livello di DNA di confronto (ad es. Ricerca contro Genbank) · M: (Livello 1, 2 o 3) indica il miglior livello di prove che abbiamo che consiste di partite alle famiglie di proteine (ad es. PFAM) o noti pattern del sito vincolante (POSSITIS) Requisiti: · Java.

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