Codoncode allineer Una grande applicazione per il montaggio della sequenza, la modifica del contig e il rilevamento della mutazione
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Una grande applicazione per l'assemblaggio della sequenza, la modifica del contig e il rilevamento della mutazione Codoncode Aligner è un programma per il gruppo di sequenze, la modifica del contig e il rilevamento della mutazione, disponibile per Windows e Mac OS X. Aligner è compatibile con Phred-Phroup e supporta completamente i punteggi di qualità della sequenza, mentre offre un'interfaccia utente familiare e facile da imparare .Codoncode Aligner consente di sfruttare appieno gli algoritmi moderni per il assemblaggio delle chiamate e della sequenza di base, senza costringerti a imparare opzioni di riga di comando complicate o programmazione perl. Ecco alcune caratteristiche chiave di "Codoncode Aligner": · Importare sequenze dai file di testo. · Importare sequenze da file ABI e SCF. · Fine clip. · Trim vettoriale. · Assemblare contigs. · Allineare a una sequenza di riferimento. · Allineare i contigli l'un l'altro mantenendo i collegamenti alle tracce. · Assemblare o allineare in gruppi, in base ai nomi dei campioni. · Trova mutazioni eterozigote. · Analizzare inserzioni e cancellazioni eterozigote. · Definire regioni di interesse ("Caratteristiche"), ad esempio Regioni di consenso di bassa qualità. · Naviga rapidamente tra le funzioni definite dall'utente. · Importa e modifica assemblee generati da truffe. · Esegui Phred e Phrap direttamente dai progetti Aligner. · Hai anche la possibilità di esportare funzioni e sequenze. · Progetti di assemblaggio compatibili con esportazione. Limitazioni: · Periodo di prova di 30 giorni. · È possibile utilizzare nei tuoi progetti solo campioni non assegnati. · Inoltre, non è possibile salvare, esportare o stampare da progetti che contengono Contigs, o dopo aver provato una delle funzioni limitate (Aligner ti avverterà prima). Cosa c'è di nuovo in questa versione: · Traduzione di amminoacidi per tutti i campioni. · Colori di sfondo basati sulla traduzione proteica. · Tabelle di differenza. · Importa direttamente da Genbank. · Menu script. · Nuovi comandi di script. · Importa 454 Dati (file SFF). · Creare nuove sequenze di testo. · Supporta progetti più grandi. · Assemblee più veloci. · Utilizzare la memoria automatica su Windows. · Supporto per tablet a penna migliorato.

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