CcDeep.

Cromatina Conformation Proect Analysis
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CcDeep. Classifica e riepilogo

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  • Rating:
  • Licenza:
  • Freeware
  • Nome editore:
  • lunacab
  • Sistemi operativi:
  • Mac OS X
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CcDeep. Tag


CcDeep. Descrizione

Lo strumento CCDeep (Chromatin Conformation Analysis Analysis Analysis consente di analizzare i dati di sequenziamento della conformazione della cromatina da esperimenti hi-c. CCDeep può elaborare i dati in base a diversi fattori: · Filtra sequenze out con bassa qualità, in base alla loro mappatura lontana dal sito di restrizione selezionata del sito enzimatico o dal loro attacco alle regioni con bassa maffabilità · Produce un'enumerazione e quantificazione (crudo e normalizzato) di coppie di estremità del frammento · Riassupa la visualizzazione della quantificazione di prevenzione (contenuto GC, lunghezza del frammento e maffabilità) Istruzioni dettagliate su come installare e utilizzare l'utilità CCDeep sul tuo Mac sono disponibili qui. CCDeep è multipiattaforma e funziona su Mac OS X e Linux. I binari per la piattaforma Linux sono disponibili nella homepage del progetto.


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