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Programma di bioinformatico per analisi avanzate di proteine e dna. Questa 2 x 2 settimane di demo completamente funzionale di BBECNECK CLC Aggrega tutte le analisi della sequenza del DNA di Gene Workbench del Gene CLC e tutte le analisi della sequenza di proteine del workbench CLC Protein Bannello di lavoro principale è uno strumento che integra tutte le analisi in un unico, user-friendly, e applicazione software intuitiva. Ecco alcune caratteristiche chiave di "CLC Main Workbench": · Assemblaggio dei dati di sequenziamento del DNA. · Design avanzato del primer. · Clonazione molecolare. · Annotazione automatica SNP di sequenze. · Pronostico della struttura proteica secondaria. · Vista molecolare 3D integrata. · Previsione del peptide del segnale (SEMBALP). · Pronostico di elica transmembrana (TMHMM). · Analisi della famiglia delle proteine (PFAM). · 2 tipi di allineamenti. · Phylogenetics. · Ricerca motivi (modelli noti). · Discovery del modello (modelli sconosciuti). · RAFFICA. · Elaborazione batch di più analisi in un unico passaggio. · Plot Dot. · Analisi dell'idrofobicità. · Analisi antigenicità. · Ricerche su Genbank, Swissprot, Trembl e Pubmed. · Registro dettagliato di azioni / analisi eseguite. Requisiti: · Richiesto 256 MB di RAM. · Consigliato 512 MB RAM. · Display 1024 x 768 Consigliato. Limitazioni: · Periodo di prova completamente funzionale di 4 settimane. Cosa c'è di nuovo in questa versione: Analisi dell'espressione: · Plot Volcano: ora puoi scegliere i valori per tracciare sull'asse X. Scegli tra "differenza" e "fold cambia". Per saperne di più... · La vista tabella dei grafici delle barre mostra gli stessi intervalli come mostrato nella trama della barra. · Importatore generico per i dati dell'array di espressione in formato tabulare. Per saperne di più... · Importatore generico per i dati di annotazione dell'esperimento di espressione in formato tabellare. Per saperne di più... · I file GENE ONTOLOGY (GO) possono ora essere utilizzati per annotare un esperimento di espressioni. Per saperne di più... · Tag Profiling: non sei più autorizzato ad annotare i campioni di tag, solo gli esperimenti · Il pannello laterale della tabella di esperimento è stato re-organizzato per fornire una migliore panoramica. Per saperne di più... · L'apertura della sequenza di consenso comprendente le lacune inserirà anche ns prima che inizi la sequenza di consenso e dopo la fine Distribuzione: · È possibile impostare un percorso per la posizione dei dati predefinita utilizzata quando il workbench inizia per la prima volta. Questa è una funzione per aiutare il controllo degli amministratori di sistema in cui le nuove installazioni per impostazione predefinita salvano i loro dati. Per saperne di più... · Supporto per la rimozione degli strumenti che accedono a Internet (NCBI BLAST, notifiche di aggiornamento ecc.). Per saperne di più... Importazione generale ed esportazione: · Supporto per l'importazione di regioni complesse dei file GFF · Esportare tabelle e report in formato Excel. · Importa la sezione del manuale dell'utente ri-strutturato per fornire una migliore panoramica. Leggi di più .... Gli importatori di dati di espressione sono ora descritti nei dettagli tecnici in una sezione separata. Per saperne di più.... · Ora è possibile esportare più elenchi di sequenze in formato Facta · L'importazione forzata di file ZIP è ora supportata (costringerà all'importazione del contenuto del file zip) · L'importazione standard ora accetta i file Gzip e TAR e ZIP · Se un'importazione forzata fallisce, ci saranno più informazioni tecniche su ciò che è andato storto, consentendo di identificare una cattiva formattazione dei file di importazione · Sia l'importatore Genbank che GFF ora fa diversi tentativi di denominazione dei geni che non hanno un nome genico. Prova in modo vario le seguenti qualificazioni: "Prodotto", "locus_tag", "proteina_id" e "trascrizione_id" · Quando si importano i file Genbank in cui la lunghezza indicata non corrisponde alla sequenza effettiva, viene visualizzato un avviso ma la sequenza è accettata. · Durante l'esportazione in formato CSV, le impostazioni della locale vengono utilizzate per determinare se la virgola o i semi-colons debba essere utilizzata come delimitatore (virgola utilizzata per noi locali) · Il plug-in GFF è stato aggiornato per accettare annotazioni complesse Varie: · Retipting avanzato delle annotazioni utilizzando la tabella di annotazione. Per saperne di più... · Report migliorata delle situazioni quando un disco completo impedisce il risparmio di dati · Download di sequenze utilizzando Drag and Drop dalla tabella di ricerca Non crea più un nodo "Download ..." nella cartella. Il processo di download può essere monitorato nella scheda Processi. · Primer Design ora supporta i frammenti PCR superiori a 5000 BP. · Estrarre sequenze spostate da File Manu a Toolbox-> Analisi della sequenza generale. Per saperne di più... · Migliori feedback progressi su vari dialoghi Correzioni di bug: · Problema fisso visualizzando l'etichetta "Copia ..." quando si copia i dati e quindi aggiornando la cartella · Problema fisso con denominazione delle schede. La correzione indica che sui dati non asfaltati di Windows e Linux ora ottiene un * piuttosto che rendere il nome della scheda in grassetto e corsivo. (Questo è sempre stato il comportamento su Mac OS X).

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