Arcadia. Un'applicazione desktop leggero progettata per visualizzare reti biologiche come percorsi metabolici
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visualizzare Visualizza la molecola reti biologiche percorsi metabolici molecola Biologia

Arcadia. Descrizione

Un'applicazione desktop leggero progettata per visualizzare reti biologiche come percorsi metabolici Arcadia è uno spettatore, non un editor: questo significa un'interfaccia più semplice, offrendo più prospettive sugli stessi dati, con un focus sulla navigazione.A un componente leggero e standalone, l'Arcadia è facile da implementare e mantenere. Al fine di garantire l'interoperabilità con altri strumenti, è fatto uno sforzo per supportare norme esistenti o emergenti come SBML e SBGN.A Quadro di riferimento per lo sviluppo di Arcadia è Utopia: un set open source, interoperabile di strumenti desktop per l'analisi delle proteine, Costruito secondo il modello di modello / vista / controller. Questo approccio, insieme alla programmazione orientato all'oggetto, compensa il software flessibile e evolutivo.Arcadia è la piattaforma multipiattaforma ed è sviluppata principalmente in C ++. Arcadia fa uso di potenti librerie open source esistenti: · libsbml => un'interfaccia ai file di percorso SBML · La libreria grafico boost => una struttura del grafico efficiente · Graphviz => Algoritmi di layout classici · LibaVoid => Routing del bordo dinamico · Qt => L'interfaccia utente grafica Ecco alcune caratteristiche chiave di "Arcadia": · Elenchi ordinati di reazioni e specie biochimiche · Proprietà dettagliate degli elementi selezionati · Rappresentanze grafiche dell'intera rete · Mappe locali? Per gruppi di molecole vicine Requisiti: · C ++.

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