3DNA.

3DNA - Analizzare e ricostruire strutture acide nucleiche 3D, in base a un telaio di riferimento standard.
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3DNA. Classifica e riepilogo

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  • Rating:
  • Licenza:
  • Freeware
  • Prezzo:
  • FREE
  • Nome editore:
  • Dr. Xiang-Jun Lu
  • Sito web dell'editore:
  • http://rutchem.rutgers.edu/~xiangjun/3DNA/
  • Sistemi operativi:
  • Mac OS X or later
  • Dimensione del file:
  • 2.5 MB

3DNA. Tag


3DNA. Descrizione

3DNA - Analizza e ricostruisci le strutture acide nucleiche 3D, in base a un telaio di riferimento standard. 3DNA è un pacchetto versatile per analizzare e ricostruire strutture di acido nucleico tridimensionale, in base a un telaio di riferimento standard. Nel suo nucleo, il software utilizza un schema semplice, ma matematicamente rigoroso e geometrico, per il calcolo di un set completo di base locale Paia, passo e parametri elicoidali e consente di ricostruire esatti di una struttura basata su questi parametri. Le caratteristiche dellaunica di 3DNA includono la classificazione automatica di un gradino di Dinucleotide come A-, B-, o TA-simile in base al posizionamento del fosforo Atomi e la generazione di diagrammi di impilazione di base "standardizzati". Gli stile di Calladine-Drew riceve rappresentazioni schematiche come modelli atomici completi con il backbone di zucchero-fosfato e del DNA anche grazie alla routine di ricostruzione.3DNA è stato creato dal Dr. Xiang-Jun Lu nel laboratorio del professor Wilma K. Olson al Dipartimento di Chimica e Biologia chimica, Rutgers: l'Università Statale del New Jersey. Da quando lasciando Rutgers, il Dr. LU ha continuato a lavorare su questo progetto come consulente indipendente nel suo tempo libero. Questo sito aggiornato fornisce agli utenti ulteriori informazioni di base e dettagli tecnici su 3DNA, compresi esempi di lavoro. Pertanto, coloro che sono veramente interessati alle strutture di acido nucleico possono avere una chiara comprensione di "cosa sta succedendo in quella scatola nera" .3dna ha beneficiato notevolmente dalle interazioni con il progetto Nucleic Acid Database (NDB) LED dal professor Helen Berman. Dr. Zukang Feng al PDB / NDB, Dr. AR Srinivarsan, la signora Yurong Xin, il signor Andrew Colasanti, il signor Jin Tao, la signora Fei Xu e altri membri del laboratorio Olson. E numerosi utenti di tutto il mondo hanno contribuito a rendere 3DNA uno strumento migliore per servire la comunità scientifica.


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