simbio. Simbio è un pacchetto Java per creare modelli biologici per biologo e altri.
Scarica ora

simbio. Classifica e riepilogo

simbio. Tag

applicazione java Cellula modellazione modello biologico Cellule cardiache Cardiaco

simbio. Descrizione

Simbio è un pacchetto Java per creare modelli biologici per biologo e altri. Simbio è un pacchetto Java per creare modelli biologici per biologo e altri. Sono disponibili modelli di cellule cardiache.Simbio è un simulatore per sistemi biologici come cellule cardiache, cellule epiteliali e cellule pancreatiche. Simbio è scritto in Java, utilizza XML e può risolvere equazioni differenziali ordinarie. Nel campo della biologia medica, sono stati accumulati risultati di ricerca estesi relativi alle funzioni di livello molecolare e cellulare, ma i meccanismi di queste complesse funzioni di cellule non possono essere spiegati quantitativamente. A causa di questo fatto, un modello dinamico quantitativo che può integrare i dati sperimentali e riprodurre i meccanismi biologici sui computer è importante. Abbiamo sviluppato Simbio per avere uno strumento per una facile creazione di modelli cellulari che impiegano principi orientati agli oggetti. In Simbio, i modelli matematici come un modello Myocyte descritto utilizzando le normali equazioni differenziali sono suddivisi in elementi di funzione come canali ioni e variabili come le concentrazioni di ioni. In questo nuovo modo di sviluppare modelli di celle, gli elementi funzione sono ugualmente indipendenti e possono essere raggruppati in base alle classificazioni biologiche. Inoltre, le correlazioni di variabili e elementi funzione possono essere descritte come un grafico. L'obiettivo è uno strumento con cui varie funzioni e meccanismi cellulari basati sui risultati sperimentali possono essere facilmente combinati ad una struttura cellulare più complessa o anche ad un'intera cella adatta per esplorare nuovi ipotesi.Simbio è uno strumento per renderlo più facile da costruire Modelli di organismi cellulari e per promuovere la condivisione / riutilizzo dei modelli. Fornisce le funzionalità necessarie per creare modelli che utilizzano equazioni differenziali ordinarie e modelli matematici, eseguire il calcolo integrale, i grafici dei risultati del display, estratto i risultati su file, modificare i parametri e fanno i calcoli. La struttura di Simbio è divisa in 3 elementi principali. Il primo descrive i calcoli dei modelli matematici con Java. Il secondo descrive i valori iniziali dei parametri e la struttura dei modelli matematici con i file XML. Il terzo risolve i problemi di valore iniziale delle equazioni differenziali ordinarie con un motore di integrazione. Requisiti: · JDK 1.4 o successivo · LOG4J. · Versione Xalan 2.7.0

simbio. Software correlato